Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Scamp5Q9JKD3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Scamp5Q9JKD3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Scamp5Q9JKD3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Scamp5Q9JKD3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Scamp5Q9JKD3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Scamp5Q9JKD3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Scamp5Q9JKD3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Scamp5Q9JKD3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Scamp5Q9JKD3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Scamp5Q9JKD3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Scamp5Q9JKD3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Scamp5Q9JKD3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Scamp5Q9JKD3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Scamp5Q9JKD3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Scamp5Q9JKD3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Scamp5Q9JKD3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Scamp5Q9JKD3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Scamp5Q9JKD3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Scamp5Q9JKD3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Scamp5Q9JKD3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Scamp5Q9JKD3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Scamp5Q9JKD3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Scamp5Q9JKD3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Scamp5Q9JKD3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Scamp5Q9JKD3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Scamp5Q9JKD3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Scamp5Q9JKD3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scamp5Q9JKD3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scamp5Q9JKD3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Scamp5Q9JKD3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scamp5Q9JKD3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scamp5Q9JKD3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scamp5Q9JKD3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scamp5Q9JKD3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scamp5Q9JKD3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scamp5Q9JKD3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scamp5Q9JKD3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Scamp5Q9JKD3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Scamp5Q9JKD3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Scamp5Q9JKD3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Scamp5Q9JKD3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Scamp5Q9JKD3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Scamp5Q9JKD3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Scamp5Q9JKD3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Scamp5Q9JKD3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Scamp5Q9JKD3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Scamp5Q9JKD3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Scamp5Q9JKD3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Scamp5Q9JKD3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Scamp5Q9JKD3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Scamp5Q9JKD3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Scamp5Q9JKD3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Scamp5Q9JKD3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Scamp5Q9JKD3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Scamp5Q9JKD3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Scamp5Q9JKD3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Scamp5Q9JKD3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Scamp5Q9JKD3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Scamp5Q9JKD3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Scamp5Q9JKD3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Scamp5Q9JKD3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Scamp5Q9JKD3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Scamp5Q9JKD3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Scamp5Q9JKD3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Scamp5Q9JKD3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Scamp5Q9JKD3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Scamp5Q9JKD3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Scamp5Q9JKD3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Scamp5Q9JKD3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Scamp5Q9JKD3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Scamp5Q9JKD3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Scamp5Q9JKD3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Scamp5Q9JKD3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Scamp5Q9JKD3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Scamp5Q9JKD3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Scamp5Q9JKD3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Scamp5Q9JKD3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Scamp5Q9JKD3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Scamp5Q9JKD3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Scamp5Q9JKD3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Scamp5Q9JKD3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Scamp5Q9JKD3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Scamp5Q9JKD3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Scamp5Q9JKD3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Scamp5Q9JKD3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Scamp5Q9JKD3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Scamp5Q9JKD3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Scamp5Q9JKD3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Scamp5Q9JKD3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Scamp5Q9JKD3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Scamp5Q9JKD3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Scamp5Q9JKD3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Scamp5Q9JKD3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Scamp5Q9JKD3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Scamp5Q9JKD3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Scamp5Q9JKD3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Scamp5Q9JKD3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Scamp5Q9JKD3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Scamp5Q9JKD3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms