Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pard6bQ9JK83 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pard6bQ9JK83 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pard6bQ9JK83 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pard6bQ9JK83 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pard6bQ9JK83 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pard6bQ9JK83 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Pard6bQ9JK83 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pard6bQ9JK83 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Pard6bQ9JK83 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pard6bQ9JK83 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pard6bQ9JK83 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pard6bQ9JK83 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pard6bQ9JK83 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pard6bQ9JK83 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pard6bQ9JK83 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pard6bQ9JK83 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pard6bQ9JK83 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pard6bQ9JK83 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pard6bQ9JK83 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pard6bQ9JK83 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pard6bQ9JK83 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pard6bQ9JK83 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pard6bQ9JK83 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pard6bQ9JK83 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pard6bQ9JK83 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pard6bQ9JK83 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pard6bQ9JK83 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pard6bQ9JK83 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pard6bQ9JK83 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pard6bQ9JK83 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pard6bQ9JK83 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Pard6bQ9JK83 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pard6bQ9JK83 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pard6bQ9JK83 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pard6bQ9JK83 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pard6bQ9JK83 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pard6bQ9JK83 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pard6bQ9JK83 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pard6bQ9JK83 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pard6bQ9JK83 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pard6bQ9JK83 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pard6bQ9JK83 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pard6bQ9JK83 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pard6bQ9JK83 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pard6bQ9JK83 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pard6bQ9JK83 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pard6bQ9JK83 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pard6bQ9JK83 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pard6bQ9JK83 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pard6bQ9JK83 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pard6bQ9JK83 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pard6bQ9JK83 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pard6bQ9JK83 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pard6bQ9JK83 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pard6bQ9JK83 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pard6bQ9JK83 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pard6bQ9JK83 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pard6bQ9JK83 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pard6bQ9JK83 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pard6bQ9JK83 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pard6bQ9JK83 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pard6bQ9JK83 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pard6bQ9JK83 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pard6bQ9JK83 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pard6bQ9JK83 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pard6bQ9JK83 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Pard6bQ9JK83 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pard6bQ9JK83 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pard6bQ9JK83 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pard6bQ9JK83 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pard6bQ9JK83 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pard6bQ9JK83 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pard6bQ9JK83 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pard6bQ9JK83 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pard6bQ9JK83 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pard6bQ9JK83 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Pard6bQ9JK83 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pard6bQ9JK83 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Pard6bQ9JK83 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pard6bQ9JK83 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pard6bQ9JK83 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pard6bQ9JK83 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pard6bQ9JK83 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pard6bQ9JK83 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pard6bQ9JK83 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pard6bQ9JK83 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pard6bQ9JK83 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pard6bQ9JK83 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pard6bQ9JK83 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Pard6bQ9JK83 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Pard6bQ9JK83 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pard6bQ9JK83 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Pard6bQ9JK83 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pard6bQ9JK83 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pard6bQ9JK83 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Pard6bQ9JK83 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pard6bQ9JK83 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pard6bQ9JK83 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Pard6bQ9JK83 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms