Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK42

Pdk2, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdk2Q9JK42 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pdk2Q9JK42 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pdk2Q9JK42 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pdk2Q9JK42 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pdk2Q9JK42 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pdk2Q9JK42 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pdk2Q9JK42 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pdk2Q9JK42 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pdk2Q9JK42 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pdk2Q9JK42 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pdk2Q9JK42 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pdk2Q9JK42 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pdk2Q9JK42 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pdk2Q9JK42 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pdk2Q9JK42 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pdk2Q9JK42 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pdk2Q9JK42 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pdk2Q9JK42 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pdk2Q9JK42 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Pdk2Q9JK42 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Pdk2Q9JK42 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pdk2Q9JK42 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Pdk2Q9JK42 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Pdk2Q9JK42 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Pdk2Q9JK42 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Pdk2Q9JK42 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Pdk2Q9JK42 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pdk2Q9JK42 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Pdk2Q9JK42 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pdk2Q9JK42 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pdk2Q9JK42 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pdk2Q9JK42 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pdk2Q9JK42 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pdk2Q9JK42 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pdk2Q9JK42 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pdk2Q9JK42 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pdk2Q9JK42 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pdk2Q9JK42 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pdk2Q9JK42 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pdk2Q9JK42 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pdk2Q9JK42 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pdk2Q9JK42 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pdk2Q9JK42 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pdk2Q9JK42 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pdk2Q9JK42 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pdk2Q9JK42 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pdk2Q9JK42 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pdk2Q9JK42 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pdk2Q9JK42 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pdk2Q9JK42 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pdk2Q9JK42 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pdk2Q9JK42 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pdk2Q9JK42 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pdk2Q9JK42 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pdk2Q9JK42 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pdk2Q9JK42 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Pdk2Q9JK42 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdk2Q9JK42 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdk2Q9JK42 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdk2Q9JK42 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdk2Q9JK42 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdk2Q9JK42 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdk2Q9JK42 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdk2Q9JK42 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdk2Q9JK42 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdk2Q9JK42 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdk2Q9JK42 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdk2Q9JK42 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdk2Q9JK42 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdk2Q9JK42 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdk2Q9JK42 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdk2Q9JK42 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdk2Q9JK42 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdk2Q9JK42 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdk2Q9JK42 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdk2Q9JK42 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdk2Q9JK42 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdk2Q9JK42 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdk2Q9JK42 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdk2Q9JK42 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdk2Q9JK42 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdk2Q9JK42 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdk2Q9JK42 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdk2Q9JK42 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Pdk2Q9JK42 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pdk2Q9JK42 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pdk2Q9JK42 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pdk2Q9JK42 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pdk2Q9JK42 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pdk2Q9JK42 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pdk2Q9JK42 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pdk2Q9JK42 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pdk2Q9JK42 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pdk2Q9JK42 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pdk2Q9JK42 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pdk2Q9JK42 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pdk2Q9JK42 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pdk2Q9JK42 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pdk2Q9JK42 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pdk2Q9JK42 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms