Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJR7

Ascl3, Achaete-scute homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl3Q9JJR7 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ascl3Q9JJR7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ascl3Q9JJR7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Ascl3Q9JJR7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ascl3Q9JJR7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ascl3Q9JJR7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ascl3Q9JJR7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ascl3Q9JJR7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ascl3Q9JJR7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ascl3Q9JJR7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ascl3Q9JJR7 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ascl3Q9JJR7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ascl3Q9JJR7 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ascl3Q9JJR7 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ascl3Q9JJR7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ascl3Q9JJR7 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ascl3Q9JJR7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ascl3Q9JJR7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ascl3Q9JJR7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ascl3Q9JJR7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ascl3Q9JJR7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ascl3Q9JJR7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ascl3Q9JJR7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ascl3Q9JJR7 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ascl3Q9JJR7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ascl3Q9JJR7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ascl3Q9JJR7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ascl3Q9JJR7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ascl3Q9JJR7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ascl3Q9JJR7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ascl3Q9JJR7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ascl3Q9JJR7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ascl3Q9JJR7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ascl3Q9JJR7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ascl3Q9JJR7 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ascl3Q9JJR7 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ascl3Q9JJR7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ascl3Q9JJR7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ascl3Q9JJR7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ascl3Q9JJR7 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ascl3Q9JJR7 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ascl3Q9JJR7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ascl3Q9JJR7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ascl3Q9JJR7 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ascl3Q9JJR7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ascl3Q9JJR7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ascl3Q9JJR7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ascl3Q9JJR7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ascl3Q9JJR7 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ascl3Q9JJR7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ascl3Q9JJR7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ascl3Q9JJR7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ascl3Q9JJR7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ascl3Q9JJR7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ascl3Q9JJR7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ascl3Q9JJR7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ascl3Q9JJR7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ascl3Q9JJR7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ascl3Q9JJR7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ascl3Q9JJR7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ascl3Q9JJR7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ascl3Q9JJR7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ascl3Q9JJR7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ascl3Q9JJR7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ascl3Q9JJR7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ascl3Q9JJR7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ascl3Q9JJR7 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ascl3Q9JJR7 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ascl3Q9JJR7 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ascl3Q9JJR7 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ascl3Q9JJR7 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ascl3Q9JJR7 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ascl3Q9JJR7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ascl3Q9JJR7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ascl3Q9JJR7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ascl3Q9JJR7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ascl3Q9JJR7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ascl3Q9JJR7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ascl3Q9JJR7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ascl3Q9JJR7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ascl3Q9JJR7 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ascl3Q9JJR7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ascl3Q9JJR7 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ascl3Q9JJR7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ascl3Q9JJR7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ascl3Q9JJR7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ascl3Q9JJR7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ascl3Q9JJR7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ascl3Q9JJR7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ascl3Q9JJR7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ascl3Q9JJR7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ascl3Q9JJR7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ascl3Q9JJR7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ascl3Q9JJR7 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ascl3Q9JJR7 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ascl3Q9JJR7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ascl3Q9JJR7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ascl3Q9JJR7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ascl3Q9JJR7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ascl3Q9JJR7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms