Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJK5

Herpud1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herpud1Q9JJK5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Herpud1Q9JJK5 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Herpud1Q9JJK5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Herpud1Q9JJK5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Herpud1Q9JJK5 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Herpud1Q9JJK5 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Herpud1Q9JJK5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Herpud1Q9JJK5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Herpud1Q9JJK5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Herpud1Q9JJK5 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Herpud1Q9JJK5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Herpud1Q9JJK5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Herpud1Q9JJK5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Herpud1Q9JJK5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Herpud1Q9JJK5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Herpud1Q9JJK5 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Herpud1Q9JJK5 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Herpud1Q9JJK5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Herpud1Q9JJK5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Herpud1Q9JJK5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Herpud1Q9JJK5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Herpud1Q9JJK5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Herpud1Q9JJK5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Herpud1Q9JJK5 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Herpud1Q9JJK5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Herpud1Q9JJK5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Herpud1Q9JJK5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Herpud1Q9JJK5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Herpud1Q9JJK5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Herpud1Q9JJK5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Herpud1Q9JJK5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Herpud1Q9JJK5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Herpud1Q9JJK5 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Herpud1Q9JJK5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Herpud1Q9JJK5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Herpud1Q9JJK5 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Herpud1Q9JJK5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Herpud1Q9JJK5 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Herpud1Q9JJK5 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Herpud1Q9JJK5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Herpud1Q9JJK5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Herpud1Q9JJK5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Herpud1Q9JJK5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Herpud1Q9JJK5 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Herpud1Q9JJK5 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Herpud1Q9JJK5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Herpud1Q9JJK5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Herpud1Q9JJK5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Herpud1Q9JJK5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Herpud1Q9JJK5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Herpud1Q9JJK5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Herpud1Q9JJK5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Herpud1Q9JJK5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Herpud1Q9JJK5 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Herpud1Q9JJK5 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Herpud1Q9JJK5 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Herpud1Q9JJK5 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Herpud1Q9JJK5 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Herpud1Q9JJK5 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Herpud1Q9JJK5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Herpud1Q9JJK5 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Herpud1Q9JJK5 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms