Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smad9Q9JIW5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smad9Q9JIW5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smad9Q9JIW5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smad9Q9JIW5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smad9Q9JIW5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smad9Q9JIW5 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smad9Q9JIW5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smad9Q9JIW5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smad9Q9JIW5 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smad9Q9JIW5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smad9Q9JIW5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smad9Q9JIW5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smad9Q9JIW5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smad9Q9JIW5 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smad9Q9JIW5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smad9Q9JIW5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smad9Q9JIW5 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smad9Q9JIW5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smad9Q9JIW5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smad9Q9JIW5 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smad9Q9JIW5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smad9Q9JIW5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Smad9Q9JIW5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Smad9Q9JIW5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Smad9Q9JIW5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smad9Q9JIW5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smad9Q9JIW5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smad9Q9JIW5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smad9Q9JIW5 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smad9Q9JIW5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Smad9Q9JIW5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smad9Q9JIW5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smad9Q9JIW5 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smad9Q9JIW5 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smad9Q9JIW5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smad9Q9JIW5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smad9Q9JIW5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smad9Q9JIW5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smad9Q9JIW5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smad9Q9JIW5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smad9Q9JIW5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smad9Q9JIW5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smad9Q9JIW5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smad9Q9JIW5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smad9Q9JIW5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smad9Q9JIW5 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smad9Q9JIW5 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smad9Q9JIW5 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smad9Q9JIW5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smad9Q9JIW5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smad9Q9JIW5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smad9Q9JIW5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smad9Q9JIW5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smad9Q9JIW5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smad9Q9JIW5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smad9Q9JIW5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smad9Q9JIW5 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smad9Q9JIW5 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smad9Q9JIW5 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smad9Q9JIW5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smad9Q9JIW5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smad9Q9JIW5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smad9Q9JIW5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smad9Q9JIW5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smad9Q9JIW5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smad9Q9JIW5 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smad9Q9JIW5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smad9Q9JIW5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smad9Q9JIW5 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smad9Q9JIW5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smad9Q9JIW5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smad9Q9JIW5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smad9Q9JIW5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smad9Q9JIW5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smad9Q9JIW5 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smad9Q9JIW5 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smad9Q9JIW5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smad9Q9JIW5 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smad9Q9JIW5 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Smad9Q9JIW5 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smad9Q9JIW5 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smad9Q9JIW5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Smad9Q9JIW5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smad9Q9JIW5 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smad9Q9JIW5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Smad9Q9JIW5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smad9Q9JIW5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smad9Q9JIW5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Smad9Q9JIW5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smad9Q9JIW5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smad9Q9JIW5 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smad9Q9JIW5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smad9Q9JIW5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smad9Q9JIW5 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smad9Q9JIW5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smad9Q9JIW5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smad9Q9JIW5 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smad9Q9JIW5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smad9Q9JIW5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms