Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lmbr1Q9JIT0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lmbr1Q9JIT0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lmbr1Q9JIT0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Lmbr1Q9JIT0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Lmbr1Q9JIT0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lmbr1Q9JIT0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lmbr1Q9JIT0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lmbr1Q9JIT0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lmbr1Q9JIT0 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lmbr1Q9JIT0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lmbr1Q9JIT0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lmbr1Q9JIT0 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lmbr1Q9JIT0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lmbr1Q9JIT0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lmbr1Q9JIT0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lmbr1Q9JIT0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lmbr1Q9JIT0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lmbr1Q9JIT0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lmbr1Q9JIT0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lmbr1Q9JIT0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lmbr1Q9JIT0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lmbr1Q9JIT0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Lmbr1Q9JIT0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lmbr1Q9JIT0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lmbr1Q9JIT0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lmbr1Q9JIT0 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lmbr1Q9JIT0 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lmbr1Q9JIT0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lmbr1Q9JIT0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lmbr1Q9JIT0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lmbr1Q9JIT0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lmbr1Q9JIT0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lmbr1Q9JIT0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lmbr1Q9JIT0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lmbr1Q9JIT0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lmbr1Q9JIT0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lmbr1Q9JIT0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lmbr1Q9JIT0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lmbr1Q9JIT0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Lmbr1Q9JIT0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lmbr1Q9JIT0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lmbr1Q9JIT0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lmbr1Q9JIT0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Lmbr1Q9JIT0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lmbr1Q9JIT0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lmbr1Q9JIT0 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lmbr1Q9JIT0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lmbr1Q9JIT0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lmbr1Q9JIT0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lmbr1Q9JIT0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lmbr1Q9JIT0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lmbr1Q9JIT0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Lmbr1Q9JIT0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lmbr1Q9JIT0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lmbr1Q9JIT0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lmbr1Q9JIT0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lmbr1Q9JIT0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lmbr1Q9JIT0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lmbr1Q9JIT0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lmbr1Q9JIT0 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lmbr1Q9JIT0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lmbr1Q9JIT0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lmbr1Q9JIT0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lmbr1Q9JIT0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lmbr1Q9JIT0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lmbr1Q9JIT0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lmbr1Q9JIT0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lmbr1Q9JIT0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lmbr1Q9JIT0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lmbr1Q9JIT0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lmbr1Q9JIT0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Lmbr1Q9JIT0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Lmbr1Q9JIT0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lmbr1Q9JIT0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lmbr1Q9JIT0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lmbr1Q9JIT0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lmbr1Q9JIT0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lmbr1Q9JIT0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lmbr1Q9JIT0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lmbr1Q9JIT0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lmbr1Q9JIT0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lmbr1Q9JIT0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lmbr1Q9JIT0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lmbr1Q9JIT0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lmbr1Q9JIT0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Lmbr1Q9JIT0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmbr1Q9JIT0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmbr1Q9JIT0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmbr1Q9JIT0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmbr1Q9JIT0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmbr1Q9JIT0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmbr1Q9JIT0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmbr1Q9JIT0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmbr1Q9JIT0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmbr1Q9JIT0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmbr1Q9JIT0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmbr1Q9JIT0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmbr1Q9JIT0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms