Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS8

Slc12a4, Solute carrier family 12 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a4Q9JIS8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc12a4Q9JIS8 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc12a4Q9JIS8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc12a4Q9JIS8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc12a4Q9JIS8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc12a4Q9JIS8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc12a4Q9JIS8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc12a4Q9JIS8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc12a4Q9JIS8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc12a4Q9JIS8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc12a4Q9JIS8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc12a4Q9JIS8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc12a4Q9JIS8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc12a4Q9JIS8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc12a4Q9JIS8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc12a4Q9JIS8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc12a4Q9JIS8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc12a4Q9JIS8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc12a4Q9JIS8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc12a4Q9JIS8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc12a4Q9JIS8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc12a4Q9JIS8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc12a4Q9JIS8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc12a4Q9JIS8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc12a4Q9JIS8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc12a4Q9JIS8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc12a4Q9JIS8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc12a4Q9JIS8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc12a4Q9JIS8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc12a4Q9JIS8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc12a4Q9JIS8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc12a4Q9JIS8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc12a4Q9JIS8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc12a4Q9JIS8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc12a4Q9JIS8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc12a4Q9JIS8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc12a4Q9JIS8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc12a4Q9JIS8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc12a4Q9JIS8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc12a4Q9JIS8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc12a4Q9JIS8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc12a4Q9JIS8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc12a4Q9JIS8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc12a4Q9JIS8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc12a4Q9JIS8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc12a4Q9JIS8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc12a4Q9JIS8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc12a4Q9JIS8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc12a4Q9JIS8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc12a4Q9JIS8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc12a4Q9JIS8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc12a4Q9JIS8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc12a4Q9JIS8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc12a4Q9JIS8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc12a4Q9JIS8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc12a4Q9JIS8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc12a4Q9JIS8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc12a4Q9JIS8 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc12a4Q9JIS8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc12a4Q9JIS8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc12a4Q9JIS8 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc12a4Q9JIS8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc12a4Q9JIS8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc12a4Q9JIS8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc12a4Q9JIS8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc12a4Q9JIS8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc12a4Q9JIS8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc12a4Q9JIS8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc12a4Q9JIS8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc12a4Q9JIS8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc12a4Q9JIS8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc12a4Q9JIS8 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc12a4Q9JIS8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc12a4Q9JIS8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc12a4Q9JIS8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc12a4Q9JIS8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc12a4Q9JIS8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc12a4Q9JIS8 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc12a4Q9JIS8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc12a4Q9JIS8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc12a4Q9JIS8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc12a4Q9JIS8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc12a4Q9JIS8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc12a4Q9JIS8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc12a4Q9JIS8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc12a4Q9JIS8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc12a4Q9JIS8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc12a4Q9JIS8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc12a4Q9JIS8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc12a4Q9JIS8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc12a4Q9JIS8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc12a4Q9JIS8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc12a4Q9JIS8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc12a4Q9JIS8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc12a4Q9JIS8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc12a4Q9JIS8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc12a4Q9JIS8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc12a4Q9JIS8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc12a4Q9JIS8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc12a4Q9JIS8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms