Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG7

Ccdc22, Coiled-coil domain-containing protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc22Q9JIG7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc22Q9JIG7 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc22Q9JIG7 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc22Q9JIG7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc22Q9JIG7 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc22Q9JIG7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc22Q9JIG7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc22Q9JIG7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc22Q9JIG7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc22Q9JIG7 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc22Q9JIG7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc22Q9JIG7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc22Q9JIG7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc22Q9JIG7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc22Q9JIG7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc22Q9JIG7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc22Q9JIG7 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc22Q9JIG7 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc22Q9JIG7 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc22Q9JIG7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc22Q9JIG7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc22Q9JIG7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc22Q9JIG7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc22Q9JIG7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc22Q9JIG7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc22Q9JIG7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc22Q9JIG7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc22Q9JIG7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc22Q9JIG7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc22Q9JIG7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc22Q9JIG7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc22Q9JIG7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc22Q9JIG7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc22Q9JIG7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc22Q9JIG7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc22Q9JIG7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc22Q9JIG7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc22Q9JIG7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc22Q9JIG7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc22Q9JIG7 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc22Q9JIG7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc22Q9JIG7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc22Q9JIG7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc22Q9JIG7 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc22Q9JIG7 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc22Q9JIG7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc22Q9JIG7 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc22Q9JIG7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc22Q9JIG7 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc22Q9JIG7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc22Q9JIG7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc22Q9JIG7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc22Q9JIG7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc22Q9JIG7 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc22Q9JIG7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc22Q9JIG7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc22Q9JIG7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc22Q9JIG7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc22Q9JIG7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc22Q9JIG7 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc22Q9JIG7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc22Q9JIG7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc22Q9JIG7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc22Q9JIG7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc22Q9JIG7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc22Q9JIG7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc22Q9JIG7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc22Q9JIG7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc22Q9JIG7 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc22Q9JIG7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc22Q9JIG7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc22Q9JIG7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc22Q9JIG7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc22Q9JIG7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc22Q9JIG7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc22Q9JIG7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc22Q9JIG7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc22Q9JIG7 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc22Q9JIG7 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc22Q9JIG7 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc22Q9JIG7 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc22Q9JIG7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc22Q9JIG7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc22Q9JIG7 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc22Q9JIG7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc22Q9JIG7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc22Q9JIG7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc22Q9JIG7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc22Q9JIG7 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc22Q9JIG7 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc22Q9JIG7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc22Q9JIG7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc22Q9JIG7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc22Q9JIG7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc22Q9JIG7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc22Q9JIG7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc22Q9JIG7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc22Q9JIG7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc22Q9JIG7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc22Q9JIG7 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms