Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIF7

Copb1, Coatomer subunit beta, mousemouse

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Length 953 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb1Q9JIF7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Copb1Q9JIF7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Copb1Q9JIF7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Copb1Q9JIF7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Copb1Q9JIF7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Copb1Q9JIF7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Copb1Q9JIF7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Copb1Q9JIF7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Copb1Q9JIF7 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Copb1Q9JIF7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Copb1Q9JIF7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Copb1Q9JIF7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Copb1Q9JIF7 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Copb1Q9JIF7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Copb1Q9JIF7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Copb1Q9JIF7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Copb1Q9JIF7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Copb1Q9JIF7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Copb1Q9JIF7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Copb1Q9JIF7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Copb1Q9JIF7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Copb1Q9JIF7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Copb1Q9JIF7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Copb1Q9JIF7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Copb1Q9JIF7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Copb1Q9JIF7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Copb1Q9JIF7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Copb1Q9JIF7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Copb1Q9JIF7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Copb1Q9JIF7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Copb1Q9JIF7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Copb1Q9JIF7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Copb1Q9JIF7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Copb1Q9JIF7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Copb1Q9JIF7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Copb1Q9JIF7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Copb1Q9JIF7 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Copb1Q9JIF7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Copb1Q9JIF7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Copb1Q9JIF7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Copb1Q9JIF7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Copb1Q9JIF7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Copb1Q9JIF7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Copb1Q9JIF7 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Copb1Q9JIF7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Copb1Q9JIF7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Copb1Q9JIF7 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Copb1Q9JIF7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Copb1Q9JIF7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Copb1Q9JIF7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Copb1Q9JIF7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Copb1Q9JIF7 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Copb1Q9JIF7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Copb1Q9JIF7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Copb1Q9JIF7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Copb1Q9JIF7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Copb1Q9JIF7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Copb1Q9JIF7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Copb1Q9JIF7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Copb1Q9JIF7 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Copb1Q9JIF7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Copb1Q9JIF7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Copb1Q9JIF7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Copb1Q9JIF7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Copb1Q9JIF7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Copb1Q9JIF7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Copb1Q9JIF7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Copb1Q9JIF7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Copb1Q9JIF7 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Copb1Q9JIF7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Copb1Q9JIF7 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Copb1Q9JIF7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Copb1Q9JIF7 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Copb1Q9JIF7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Copb1Q9JIF7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Copb1Q9JIF7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Copb1Q9JIF7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Copb1Q9JIF7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Copb1Q9JIF7 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Copb1Q9JIF7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Copb1Q9JIF7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Copb1Q9JIF7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Copb1Q9JIF7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Copb1Q9JIF7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Copb1Q9JIF7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Copb1Q9JIF7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Copb1Q9JIF7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Copb1Q9JIF7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Copb1Q9JIF7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Copb1Q9JIF7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Copb1Q9JIF7 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Copb1Q9JIF7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Copb1Q9JIF7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Copb1Q9JIF7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Copb1Q9JIF7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Copb1Q9JIF7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Copb1Q9JIF7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Copb1Q9JIF7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Copb1Q9JIF7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Copb1Q9JIF7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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