Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI74

Klhl1, Kelch-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl1Q9JI74 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klhl1Q9JI74 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Klhl1Q9JI74 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Klhl1Q9JI74 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klhl1Q9JI74 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Klhl1Q9JI74 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klhl1Q9JI74 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klhl1Q9JI74 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klhl1Q9JI74 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klhl1Q9JI74 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klhl1Q9JI74 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klhl1Q9JI74 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klhl1Q9JI74 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klhl1Q9JI74 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klhl1Q9JI74 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klhl1Q9JI74 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klhl1Q9JI74 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klhl1Q9JI74 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klhl1Q9JI74 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Klhl1Q9JI74 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klhl1Q9JI74 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klhl1Q9JI74 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klhl1Q9JI74 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klhl1Q9JI74 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klhl1Q9JI74 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klhl1Q9JI74 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl1Q9JI74 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl1Q9JI74 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl1Q9JI74 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl1Q9JI74 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl1Q9JI74 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl1Q9JI74 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl1Q9JI74 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl1Q9JI74 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl1Q9JI74 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl1Q9JI74 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl1Q9JI74 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl1Q9JI74 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl1Q9JI74 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl1Q9JI74 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl1Q9JI74 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl1Q9JI74 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl1Q9JI74 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl1Q9JI74 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl1Q9JI74 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klhl1Q9JI74 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klhl1Q9JI74 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klhl1Q9JI74 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klhl1Q9JI74 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klhl1Q9JI74 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klhl1Q9JI74 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klhl1Q9JI74 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klhl1Q9JI74 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klhl1Q9JI74 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klhl1Q9JI74 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klhl1Q9JI74 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klhl1Q9JI74 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klhl1Q9JI74 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klhl1Q9JI74 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klhl1Q9JI74 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klhl1Q9JI74 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klhl1Q9JI74 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Klhl1Q9JI74 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhl1Q9JI74 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhl1Q9JI74 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhl1Q9JI74 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhl1Q9JI74 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhl1Q9JI74 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhl1Q9JI74 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhl1Q9JI74 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhl1Q9JI74 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhl1Q9JI74 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhl1Q9JI74 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhl1Q9JI74 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhl1Q9JI74 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhl1Q9JI74 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhl1Q9JI74 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhl1Q9JI74 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhl1Q9JI74 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhl1Q9JI74 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhl1Q9JI74 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klhl1Q9JI74 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klhl1Q9JI74 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Klhl1Q9JI74 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klhl1Q9JI74 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klhl1Q9JI74 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klhl1Q9JI74 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klhl1Q9JI74 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klhl1Q9JI74 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klhl1Q9JI74 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klhl1Q9JI74 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klhl1Q9JI74 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klhl1Q9JI74 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klhl1Q9JI74 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klhl1Q9JI74 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klhl1Q9JI74 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klhl1Q9JI74 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klhl1Q9JI74 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klhl1Q9JI74 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klhl1Q9JI74 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.7 ms