Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI57

Gtf2ird1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf2ird1Q9JI57 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf2ird1Q9JI57 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf2ird1Q9JI57 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf2ird1Q9JI57 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf2ird1Q9JI57 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf2ird1Q9JI57 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf2ird1Q9JI57 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf2ird1Q9JI57 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf2ird1Q9JI57 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf2ird1Q9JI57 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf2ird1Q9JI57 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtf2ird1Q9JI57 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtf2ird1Q9JI57 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtf2ird1Q9JI57 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtf2ird1Q9JI57 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtf2ird1Q9JI57 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtf2ird1Q9JI57 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtf2ird1Q9JI57 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtf2ird1Q9JI57 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtf2ird1Q9JI57 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf2ird1Q9JI57 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf2ird1Q9JI57 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf2ird1Q9JI57 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf2ird1Q9JI57 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf2ird1Q9JI57 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf2ird1Q9JI57 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf2ird1Q9JI57 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf2ird1Q9JI57 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf2ird1Q9JI57 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf2ird1Q9JI57 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf2ird1Q9JI57 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf2ird1Q9JI57 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gtf2ird1Q9JI57 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf2ird1Q9JI57 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf2ird1Q9JI57 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf2ird1Q9JI57 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf2ird1Q9JI57 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf2ird1Q9JI57 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf2ird1Q9JI57 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf2ird1Q9JI57 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf2ird1Q9JI57 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf2ird1Q9JI57 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf2ird1Q9JI57 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf2ird1Q9JI57 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf2ird1Q9JI57 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf2ird1Q9JI57 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf2ird1Q9JI57 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf2ird1Q9JI57 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf2ird1Q9JI57 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf2ird1Q9JI57 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf2ird1Q9JI57 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf2ird1Q9JI57 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf2ird1Q9JI57 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf2ird1Q9JI57 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf2ird1Q9JI57 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf2ird1Q9JI57 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf2ird1Q9JI57 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf2ird1Q9JI57 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf2ird1Q9JI57 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf2ird1Q9JI57 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf2ird1Q9JI57 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf2ird1Q9JI57 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf2ird1Q9JI57 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf2ird1Q9JI57 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf2ird1Q9JI57 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf2ird1Q9JI57 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtf2ird1Q9JI57 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtf2ird1Q9JI57 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtf2ird1Q9JI57 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtf2ird1Q9JI57 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtf2ird1Q9JI57 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtf2ird1Q9JI57 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtf2ird1Q9JI57 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtf2ird1Q9JI57 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtf2ird1Q9JI57 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtf2ird1Q9JI57 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gtf2ird1Q9JI57 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gtf2ird1Q9JI57 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gtf2ird1Q9JI57 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gtf2ird1Q9JI57 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gtf2ird1Q9JI57 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gtf2ird1Q9JI57 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gtf2ird1Q9JI57 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gtf2ird1Q9JI57 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gtf2ird1Q9JI57 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gtf2ird1Q9JI57 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gtf2ird1Q9JI57 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gtf2ird1Q9JI57 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gtf2ird1Q9JI57 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gtf2ird1Q9JI57 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gtf2ird1Q9JI57 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gtf2ird1Q9JI57 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gtf2ird1Q9JI57 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Gtf2ird1Q9JI57 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gtf2ird1Q9JI57 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms