Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI38

Pus3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus3Q9JI38 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pus3Q9JI38 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pus3Q9JI38 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pus3Q9JI38 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pus3Q9JI38 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pus3Q9JI38 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pus3Q9JI38 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pus3Q9JI38 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pus3Q9JI38 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pus3Q9JI38 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pus3Q9JI38 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pus3Q9JI38 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pus3Q9JI38 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Pus3Q9JI38 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pus3Q9JI38 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pus3Q9JI38 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pus3Q9JI38 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pus3Q9JI38 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pus3Q9JI38 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pus3Q9JI38 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Pus3Q9JI38 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pus3Q9JI38 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pus3Q9JI38 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pus3Q9JI38 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Pus3Q9JI38 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pus3Q9JI38 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pus3Q9JI38 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pus3Q9JI38 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pus3Q9JI38 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pus3Q9JI38 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pus3Q9JI38 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pus3Q9JI38 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pus3Q9JI38 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pus3Q9JI38 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pus3Q9JI38 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pus3Q9JI38 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pus3Q9JI38 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Pus3Q9JI38 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pus3Q9JI38 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pus3Q9JI38 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pus3Q9JI38 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pus3Q9JI38 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pus3Q9JI38 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pus3Q9JI38 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pus3Q9JI38 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pus3Q9JI38 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pus3Q9JI38 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pus3Q9JI38 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pus3Q9JI38 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pus3Q9JI38 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pus3Q9JI38 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pus3Q9JI38 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pus3Q9JI38 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pus3Q9JI38 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pus3Q9JI38 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pus3Q9JI38 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pus3Q9JI38 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pus3Q9JI38 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pus3Q9JI38 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pus3Q9JI38 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pus3Q9JI38 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pus3Q9JI38 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pus3Q9JI38 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pus3Q9JI38 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pus3Q9JI38 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pus3Q9JI38 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pus3Q9JI38 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pus3Q9JI38 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pus3Q9JI38 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pus3Q9JI38 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pus3Q9JI38 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pus3Q9JI38 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pus3Q9JI38 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pus3Q9JI38 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pus3Q9JI38 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pus3Q9JI38 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pus3Q9JI38 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pus3Q9JI38 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pus3Q9JI38 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pus3Q9JI38 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pus3Q9JI38 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pus3Q9JI38 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pus3Q9JI38 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pus3Q9JI38 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pus3Q9JI38 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pus3Q9JI38 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pus3Q9JI38 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pus3Q9JI38 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pus3Q9JI38 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pus3Q9JI38 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Pus3Q9JI38 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Pus3Q9JI38 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pus3Q9JI38 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pus3Q9JI38 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pus3Q9JI38 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pus3Q9JI38 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pus3Q9JI38 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pus3Q9JI38 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pus3Q9JI38 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pus3Q9JI38 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms