Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHX2

Sp5, Transcription factor Sp5, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp5Q9JHX2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sp5Q9JHX2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sp5Q9JHX2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sp5Q9JHX2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sp5Q9JHX2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sp5Q9JHX2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sp5Q9JHX2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sp5Q9JHX2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sp5Q9JHX2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sp5Q9JHX2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sp5Q9JHX2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sp5Q9JHX2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sp5Q9JHX2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sp5Q9JHX2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sp5Q9JHX2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sp5Q9JHX2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sp5Q9JHX2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sp5Q9JHX2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sp5Q9JHX2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sp5Q9JHX2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sp5Q9JHX2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sp5Q9JHX2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sp5Q9JHX2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sp5Q9JHX2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sp5Q9JHX2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sp5Q9JHX2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sp5Q9JHX2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sp5Q9JHX2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sp5Q9JHX2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sp5Q9JHX2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sp5Q9JHX2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sp5Q9JHX2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sp5Q9JHX2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sp5Q9JHX2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sp5Q9JHX2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sp5Q9JHX2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sp5Q9JHX2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sp5Q9JHX2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sp5Q9JHX2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sp5Q9JHX2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sp5Q9JHX2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sp5Q9JHX2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sp5Q9JHX2 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sp5Q9JHX2 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sp5Q9JHX2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sp5Q9JHX2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sp5Q9JHX2 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sp5Q9JHX2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp5Q9JHX2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp5Q9JHX2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp5Q9JHX2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp5Q9JHX2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp5Q9JHX2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp5Q9JHX2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp5Q9JHX2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp5Q9JHX2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp5Q9JHX2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp5Q9JHX2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp5Q9JHX2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp5Q9JHX2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp5Q9JHX2 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp5Q9JHX2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp5Q9JHX2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp5Q9JHX2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp5Q9JHX2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp5Q9JHX2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp5Q9JHX2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp5Q9JHX2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp5Q9JHX2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp5Q9JHX2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp5Q9JHX2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp5Q9JHX2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sp5Q9JHX2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sp5Q9JHX2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sp5Q9JHX2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sp5Q9JHX2 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sp5Q9JHX2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sp5Q9JHX2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sp5Q9JHX2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sp5Q9JHX2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sp5Q9JHX2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sp5Q9JHX2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sp5Q9JHX2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sp5Q9JHX2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sp5Q9JHX2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sp5Q9JHX2 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sp5Q9JHX2 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sp5Q9JHX2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sp5Q9JHX2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sp5Q9JHX2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sp5Q9JHX2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sp5Q9JHX2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sp5Q9JHX2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sp5Q9JHX2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sp5Q9JHX2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sp5Q9JHX2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sp5Q9JHX2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sp5Q9JHX2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sp5Q9JHX2 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sp5Q9JHX2 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms