Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RabggtaQ9JHK4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RabggtaQ9JHK4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RabggtaQ9JHK4 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RabggtaQ9JHK4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RabggtaQ9JHK4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RabggtaQ9JHK4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RabggtaQ9JHK4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RabggtaQ9JHK4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RabggtaQ9JHK4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RabggtaQ9JHK4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RabggtaQ9JHK4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RabggtaQ9JHK4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RabggtaQ9JHK4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RabggtaQ9JHK4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RabggtaQ9JHK4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RabggtaQ9JHK4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RabggtaQ9JHK4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RabggtaQ9JHK4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RabggtaQ9JHK4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RabggtaQ9JHK4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RabggtaQ9JHK4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RabggtaQ9JHK4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RabggtaQ9JHK4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RabggtaQ9JHK4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RabggtaQ9JHK4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RabggtaQ9JHK4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RabggtaQ9JHK4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RabggtaQ9JHK4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RabggtaQ9JHK4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RabggtaQ9JHK4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RabggtaQ9JHK4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RabggtaQ9JHK4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RabggtaQ9JHK4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RabggtaQ9JHK4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RabggtaQ9JHK4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RabggtaQ9JHK4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RabggtaQ9JHK4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RabggtaQ9JHK4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RabggtaQ9JHK4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RabggtaQ9JHK4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RabggtaQ9JHK4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RabggtaQ9JHK4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RabggtaQ9JHK4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RabggtaQ9JHK4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RabggtaQ9JHK4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RabggtaQ9JHK4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RabggtaQ9JHK4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RabggtaQ9JHK4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RabggtaQ9JHK4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RabggtaQ9JHK4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RabggtaQ9JHK4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RabggtaQ9JHK4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RabggtaQ9JHK4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RabggtaQ9JHK4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RabggtaQ9JHK4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RabggtaQ9JHK4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RabggtaQ9JHK4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RabggtaQ9JHK4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RabggtaQ9JHK4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RabggtaQ9JHK4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RabggtaQ9JHK4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RabggtaQ9JHK4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RabggtaQ9JHK4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RabggtaQ9JHK4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RabggtaQ9JHK4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RabggtaQ9JHK4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RabggtaQ9JHK4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RabggtaQ9JHK4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RabggtaQ9JHK4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RabggtaQ9JHK4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RabggtaQ9JHK4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RabggtaQ9JHK4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RabggtaQ9JHK4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RabggtaQ9JHK4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RabggtaQ9JHK4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RabggtaQ9JHK4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RabggtaQ9JHK4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RabggtaQ9JHK4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RabggtaQ9JHK4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RabggtaQ9JHK4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RabggtaQ9JHK4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RabggtaQ9JHK4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RabggtaQ9JHK4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RabggtaQ9JHK4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RabggtaQ9JHK4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RabggtaQ9JHK4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RabggtaQ9JHK4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RabggtaQ9JHK4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RabggtaQ9JHK4 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RabggtaQ9JHK4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RabggtaQ9JHK4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RabggtaQ9JHK4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RabggtaQ9JHK4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RabggtaQ9JHK4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RabggtaQ9JHK4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RabggtaQ9JHK4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RabggtaQ9JHK4 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RabggtaQ9JHK4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RabggtaQ9JHK4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
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