Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms