Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESU6

Brd4, Bromodomain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd4Q9ESU6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Brd4Q9ESU6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Brd4Q9ESU6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Brd4Q9ESU6 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Brd4Q9ESU6 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Brd4Q9ESU6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
Brd4Q9ESU6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Brd4Q9ESU6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Brd4Q9ESU6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Brd4Q9ESU6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Brd4Q9ESU6 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Brd4Q9ESU6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Brd4Q9ESU6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Brd4Q9ESU6 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Brd4Q9ESU6 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Brd4Q9ESU6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Brd4Q9ESU6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Brd4Q9ESU6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Brd4Q9ESU6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
Brd4Q9ESU6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Brd4Q9ESU6 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Brd4Q9ESU6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Brd4Q9ESU6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Brd4Q9ESU6 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Brd4Q9ESU6 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Brd4Q9ESU6 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Brd4Q9ESU6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Brd4Q9ESU6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Brd4Q9ESU6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Brd4Q9ESU6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Brd4Q9ESU6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Brd4Q9ESU6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Brd4Q9ESU6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Brd4Q9ESU6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Brd4Q9ESU6 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Brd4Q9ESU6 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Brd4Q9ESU6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Brd4Q9ESU6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Brd4Q9ESU6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Brd4Q9ESU6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Brd4Q9ESU6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Brd4Q9ESU6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Brd4Q9ESU6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Brd4Q9ESU6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Brd4Q9ESU6 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Brd4Q9ESU6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Brd4Q9ESU6 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
Brd4Q9ESU6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Brd4Q9ESU6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Brd4Q9ESU6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Brd4Q9ESU6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Brd4Q9ESU6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Brd4Q9ESU6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Brd4Q9ESU6 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Brd4Q9ESU6 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Brd4Q9ESU6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Brd4Q9ESU6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Brd4Q9ESU6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Brd4Q9ESU6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Brd4Q9ESU6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Brd4Q9ESU6 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Brd4Q9ESU6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Brd4Q9ESU6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Brd4Q9ESU6 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Brd4Q9ESU6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Brd4Q9ESU6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Brd4Q9ESU6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Brd4Q9ESU6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Brd4Q9ESU6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Brd4Q9ESU6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Brd4Q9ESU6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Brd4Q9ESU6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Brd4Q9ESU6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Brd4Q9ESU6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Brd4Q9ESU6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Brd4Q9ESU6 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Brd4Q9ESU6 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Brd4Q9ESU6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.77
Brd4Q9ESU6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.77
Brd4Q9ESU6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Brd4Q9ESU6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
Brd4Q9ESU6 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Brd4Q9ESU6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Brd4Q9ESU6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Brd4Q9ESU6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Brd4Q9ESU6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Brd4Q9ESU6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Brd4Q9ESU6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Brd4Q9ESU6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Brd4Q9ESU6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Brd4Q9ESU6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Brd4Q9ESU6 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Brd4Q9ESU6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Brd4Q9ESU6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Brd4Q9ESU6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Brd4Q9ESU6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Brd4Q9ESU6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Brd4Q9ESU6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Brd4Q9ESU6 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Brd4Q9ESU6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms