Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc4Q9ES56 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc4Q9ES56 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc4Q9ES56 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc4Q9ES56 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc4Q9ES56 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc4Q9ES56 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc4Q9ES56 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc4Q9ES56 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc4Q9ES56 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc4Q9ES56 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc4Q9ES56 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc4Q9ES56 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc4Q9ES56 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc4Q9ES56 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc4Q9ES56 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc4Q9ES56 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc4Q9ES56 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc4Q9ES56 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc4Q9ES56 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc4Q9ES56 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc4Q9ES56 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc4Q9ES56 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc4Q9ES56 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc4Q9ES56 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc4Q9ES56 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc4Q9ES56 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc4Q9ES56 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc4Q9ES56 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc4Q9ES56 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc4Q9ES56 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc4Q9ES56 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc4Q9ES56 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc4Q9ES56 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc4Q9ES56 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc4Q9ES56 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc4Q9ES56 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc4Q9ES56 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc4Q9ES56 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc4Q9ES56 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc4Q9ES56 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc4Q9ES56 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc4Q9ES56 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc4Q9ES56 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc4Q9ES56 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc4Q9ES56 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc4Q9ES56 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc4Q9ES56 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc4Q9ES56 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc4Q9ES56 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc4Q9ES56 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc4Q9ES56 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc4Q9ES56 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc4Q9ES56 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc4Q9ES56 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc4Q9ES56 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc4Q9ES56 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc4Q9ES56 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc4Q9ES56 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc4Q9ES56 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc4Q9ES56 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc4Q9ES56 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc4Q9ES56 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc4Q9ES56 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc4Q9ES56 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc4Q9ES56 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc4Q9ES56 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc4Q9ES56 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc4Q9ES56 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc4Q9ES56 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc4Q9ES56 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc4Q9ES56 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc4Q9ES56 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc4Q9ES56 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc4Q9ES56 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc4Q9ES56 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc4Q9ES56 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc4Q9ES56 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc4Q9ES56 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc4Q9ES56 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc4Q9ES56 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc4Q9ES56 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc4Q9ES56 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc4Q9ES56 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc4Q9ES56 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc4Q9ES56 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc4Q9ES56 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc4Q9ES56 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc4Q9ES56 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc4Q9ES56 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc4Q9ES56 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc4Q9ES56 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc4Q9ES56 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc4Q9ES56 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc4Q9ES56 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc4Q9ES56 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc4Q9ES56 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc4Q9ES56 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc4Q9ES56 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc4Q9ES56 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms