Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ube3bQ9ES34 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ube3bQ9ES34 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ube3bQ9ES34 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ube3bQ9ES34 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ube3bQ9ES34 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ube3bQ9ES34 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ube3bQ9ES34 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ube3bQ9ES34 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ube3bQ9ES34 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ube3bQ9ES34 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ube3bQ9ES34 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ube3bQ9ES34 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ube3bQ9ES34 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ube3bQ9ES34 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ube3bQ9ES34 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ube3bQ9ES34 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ube3bQ9ES34 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ube3bQ9ES34 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ube3bQ9ES34 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ube3bQ9ES34 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ube3bQ9ES34 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ube3bQ9ES34 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ube3bQ9ES34 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ube3bQ9ES34 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ube3bQ9ES34 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ube3bQ9ES34 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ube3bQ9ES34 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ube3bQ9ES34 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ube3bQ9ES34 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ube3bQ9ES34 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ube3bQ9ES34 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ube3bQ9ES34 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ube3bQ9ES34 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ube3bQ9ES34 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ube3bQ9ES34 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ube3bQ9ES34 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ube3bQ9ES34 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ube3bQ9ES34 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ube3bQ9ES34 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ube3bQ9ES34 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ube3bQ9ES34 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ube3bQ9ES34 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ube3bQ9ES34 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ube3bQ9ES34 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ube3bQ9ES34 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ube3bQ9ES34 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ube3bQ9ES34 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ube3bQ9ES34 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ube3bQ9ES34 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ube3bQ9ES34 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ube3bQ9ES34 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ube3bQ9ES34 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ube3bQ9ES34 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ube3bQ9ES34 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ube3bQ9ES34 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ube3bQ9ES34 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ube3bQ9ES34 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ube3bQ9ES34 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ube3bQ9ES34 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ube3bQ9ES34 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ube3bQ9ES34 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ube3bQ9ES34 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ube3bQ9ES34 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ube3bQ9ES34 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ube3bQ9ES34 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ube3bQ9ES34 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ube3bQ9ES34 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ube3bQ9ES34 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ube3bQ9ES34 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ube3bQ9ES34 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ube3bQ9ES34 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ube3bQ9ES34 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ube3bQ9ES34 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ube3bQ9ES34 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ube3bQ9ES34 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ube3bQ9ES34 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ube3bQ9ES34 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ube3bQ9ES34 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ube3bQ9ES34 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ube3bQ9ES34 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ube3bQ9ES34 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ube3bQ9ES34 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ube3bQ9ES34 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ube3bQ9ES34 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ube3bQ9ES34 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ube3bQ9ES34 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ube3bQ9ES34 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ube3bQ9ES34 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ube3bQ9ES34 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ube3bQ9ES34 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ube3bQ9ES34 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ube3bQ9ES34 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ube3bQ9ES34 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ube3bQ9ES34 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ube3bQ9ES34 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ube3bQ9ES34 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ube3bQ9ES34 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ube3bQ9ES34 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ube3bQ9ES34 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms