Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERR7

Selenof, Selenoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenofQ9ERR7 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SelenofQ9ERR7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SelenofQ9ERR7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms