Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK7

Chrnb2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrnb2Q9ERK7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chrnb2Q9ERK7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chrnb2Q9ERK7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chrnb2Q9ERK7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chrnb2Q9ERK7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chrnb2Q9ERK7 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chrnb2Q9ERK7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chrnb2Q9ERK7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chrnb2Q9ERK7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Chrnb2Q9ERK7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chrnb2Q9ERK7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chrnb2Q9ERK7 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chrnb2Q9ERK7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chrnb2Q9ERK7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chrnb2Q9ERK7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chrnb2Q9ERK7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chrnb2Q9ERK7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Chrnb2Q9ERK7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Chrnb2Q9ERK7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chrnb2Q9ERK7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chrnb2Q9ERK7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chrnb2Q9ERK7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chrnb2Q9ERK7 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Chrnb2Q9ERK7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chrnb2Q9ERK7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chrnb2Q9ERK7 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chrnb2Q9ERK7 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrnb2Q9ERK7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrnb2Q9ERK7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrnb2Q9ERK7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrnb2Q9ERK7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrnb2Q9ERK7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrnb2Q9ERK7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrnb2Q9ERK7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrnb2Q9ERK7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrnb2Q9ERK7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrnb2Q9ERK7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrnb2Q9ERK7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrnb2Q9ERK7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrnb2Q9ERK7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrnb2Q9ERK7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrnb2Q9ERK7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrnb2Q9ERK7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrnb2Q9ERK7 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrnb2Q9ERK7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrnb2Q9ERK7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrnb2Q9ERK7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrnb2Q9ERK7 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrnb2Q9ERK7 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrnb2Q9ERK7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrnb2Q9ERK7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrnb2Q9ERK7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrnb2Q9ERK7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrnb2Q9ERK7 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrnb2Q9ERK7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrnb2Q9ERK7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrnb2Q9ERK7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrnb2Q9ERK7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrnb2Q9ERK7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrnb2Q9ERK7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrnb2Q9ERK7 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrnb2Q9ERK7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrnb2Q9ERK7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrnb2Q9ERK7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrnb2Q9ERK7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrnb2Q9ERK7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrnb2Q9ERK7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrnb2Q9ERK7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrnb2Q9ERK7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrnb2Q9ERK7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrnb2Q9ERK7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chrnb2Q9ERK7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chrnb2Q9ERK7 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chrnb2Q9ERK7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chrnb2Q9ERK7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Chrnb2Q9ERK7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Chrnb2Q9ERK7 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chrnb2Q9ERK7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chrnb2Q9ERK7 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Chrnb2Q9ERK7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chrnb2Q9ERK7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chrnb2Q9ERK7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chrnb2Q9ERK7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chrnb2Q9ERK7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chrnb2Q9ERK7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chrnb2Q9ERK7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chrnb2Q9ERK7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chrnb2Q9ERK7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chrnb2Q9ERK7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chrnb2Q9ERK7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Chrnb2Q9ERK7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chrnb2Q9ERK7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Chrnb2Q9ERK7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Chrnb2Q9ERK7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrnb2Q9ERK7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrnb2Q9ERK7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrnb2Q9ERK7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrnb2Q9ERK7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrnb2Q9ERK7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrnb2Q9ERK7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141.5 ms