Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQZ6

Rapgef4, Rap guanine nucleotide exchange factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,011 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef4Q9EQZ6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rapgef4Q9EQZ6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rapgef4Q9EQZ6 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rapgef4Q9EQZ6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rapgef4Q9EQZ6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rapgef4Q9EQZ6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rapgef4Q9EQZ6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rapgef4Q9EQZ6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rapgef4Q9EQZ6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rapgef4Q9EQZ6 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Rapgef4Q9EQZ6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rapgef4Q9EQZ6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rapgef4Q9EQZ6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rapgef4Q9EQZ6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rapgef4Q9EQZ6 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rapgef4Q9EQZ6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rapgef4Q9EQZ6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Rapgef4Q9EQZ6 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Rapgef4Q9EQZ6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rapgef4Q9EQZ6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rapgef4Q9EQZ6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rapgef4Q9EQZ6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rapgef4Q9EQZ6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rapgef4Q9EQZ6 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Rapgef4Q9EQZ6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rapgef4Q9EQZ6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rapgef4Q9EQZ6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rapgef4Q9EQZ6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rapgef4Q9EQZ6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rapgef4Q9EQZ6 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rapgef4Q9EQZ6 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rapgef4Q9EQZ6 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rapgef4Q9EQZ6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rapgef4Q9EQZ6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rapgef4Q9EQZ6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rapgef4Q9EQZ6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rapgef4Q9EQZ6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rapgef4Q9EQZ6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rapgef4Q9EQZ6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rapgef4Q9EQZ6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rapgef4Q9EQZ6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rapgef4Q9EQZ6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rapgef4Q9EQZ6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rapgef4Q9EQZ6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rapgef4Q9EQZ6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rapgef4Q9EQZ6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rapgef4Q9EQZ6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rapgef4Q9EQZ6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rapgef4Q9EQZ6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rapgef4Q9EQZ6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rapgef4Q9EQZ6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rapgef4Q9EQZ6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rapgef4Q9EQZ6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rapgef4Q9EQZ6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rapgef4Q9EQZ6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Rapgef4Q9EQZ6 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Rapgef4Q9EQZ6 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rapgef4Q9EQZ6 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rapgef4Q9EQZ6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rapgef4Q9EQZ6 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rapgef4Q9EQZ6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rapgef4Q9EQZ6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rapgef4Q9EQZ6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Rapgef4Q9EQZ6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rapgef4Q9EQZ6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rapgef4Q9EQZ6 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rapgef4Q9EQZ6 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rapgef4Q9EQZ6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rapgef4Q9EQZ6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rapgef4Q9EQZ6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rapgef4Q9EQZ6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rapgef4Q9EQZ6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Rapgef4Q9EQZ6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rapgef4Q9EQZ6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rapgef4Q9EQZ6 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Rapgef4Q9EQZ6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rapgef4Q9EQZ6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rapgef4Q9EQZ6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rapgef4Q9EQZ6 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rapgef4Q9EQZ6 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Rapgef4Q9EQZ6 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rapgef4Q9EQZ6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rapgef4Q9EQZ6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rapgef4Q9EQZ6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rapgef4Q9EQZ6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rapgef4Q9EQZ6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rapgef4Q9EQZ6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rapgef4Q9EQZ6 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Rapgef4Q9EQZ6 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Rapgef4Q9EQZ6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Rapgef4Q9EQZ6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rapgef4Q9EQZ6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rapgef4Q9EQZ6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rapgef4Q9EQZ6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rapgef4Q9EQZ6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rapgef4Q9EQZ6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rapgef4Q9EQZ6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rapgef4Q9EQZ6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rapgef4Q9EQZ6 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms