Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rpgrip1Q9EPQ2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rpgrip1Q9EPQ2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rpgrip1Q9EPQ2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rpgrip1Q9EPQ2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rpgrip1Q9EPQ2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Rpgrip1Q9EPQ2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Rpgrip1Q9EPQ2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms