Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clstn1Q9EPL2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clstn1Q9EPL2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clstn1Q9EPL2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clstn1Q9EPL2 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clstn1Q9EPL2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clstn1Q9EPL2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clstn1Q9EPL2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clstn1Q9EPL2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clstn1Q9EPL2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Clstn1Q9EPL2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clstn1Q9EPL2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clstn1Q9EPL2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clstn1Q9EPL2 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clstn1Q9EPL2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clstn1Q9EPL2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clstn1Q9EPL2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clstn1Q9EPL2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clstn1Q9EPL2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clstn1Q9EPL2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clstn1Q9EPL2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clstn1Q9EPL2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clstn1Q9EPL2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clstn1Q9EPL2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clstn1Q9EPL2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clstn1Q9EPL2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clstn1Q9EPL2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clstn1Q9EPL2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clstn1Q9EPL2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clstn1Q9EPL2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clstn1Q9EPL2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Clstn1Q9EPL2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clstn1Q9EPL2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clstn1Q9EPL2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clstn1Q9EPL2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clstn1Q9EPL2 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clstn1Q9EPL2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clstn1Q9EPL2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clstn1Q9EPL2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clstn1Q9EPL2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clstn1Q9EPL2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clstn1Q9EPL2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clstn1Q9EPL2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clstn1Q9EPL2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clstn1Q9EPL2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clstn1Q9EPL2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clstn1Q9EPL2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clstn1Q9EPL2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clstn1Q9EPL2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Clstn1Q9EPL2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clstn1Q9EPL2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clstn1Q9EPL2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clstn1Q9EPL2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clstn1Q9EPL2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clstn1Q9EPL2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clstn1Q9EPL2 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Clstn1Q9EPL2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clstn1Q9EPL2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clstn1Q9EPL2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clstn1Q9EPL2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clstn1Q9EPL2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clstn1Q9EPL2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clstn1Q9EPL2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clstn1Q9EPL2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clstn1Q9EPL2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clstn1Q9EPL2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clstn1Q9EPL2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clstn1Q9EPL2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clstn1Q9EPL2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clstn1Q9EPL2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clstn1Q9EPL2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clstn1Q9EPL2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clstn1Q9EPL2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clstn1Q9EPL2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clstn1Q9EPL2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clstn1Q9EPL2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clstn1Q9EPL2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clstn1Q9EPL2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clstn1Q9EPL2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Clstn1Q9EPL2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clstn1Q9EPL2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clstn1Q9EPL2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clstn1Q9EPL2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clstn1Q9EPL2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clstn1Q9EPL2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clstn1Q9EPL2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clstn1Q9EPL2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clstn1Q9EPL2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clstn1Q9EPL2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Clstn1Q9EPL2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clstn1Q9EPL2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clstn1Q9EPL2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clstn1Q9EPL2 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clstn1Q9EPL2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clstn1Q9EPL2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Clstn1Q9EPL2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clstn1Q9EPL2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clstn1Q9EPL2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Clstn1Q9EPL2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clstn1Q9EPL2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms