Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPK2

Rp2, Protein XRP2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp2Q9EPK2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rp2Q9EPK2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rp2Q9EPK2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Rp2Q9EPK2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rp2Q9EPK2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rp2Q9EPK2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rp2Q9EPK2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rp2Q9EPK2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rp2Q9EPK2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rp2Q9EPK2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rp2Q9EPK2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rp2Q9EPK2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rp2Q9EPK2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rp2Q9EPK2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rp2Q9EPK2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rp2Q9EPK2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rp2Q9EPK2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rp2Q9EPK2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rp2Q9EPK2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rp2Q9EPK2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rp2Q9EPK2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rp2Q9EPK2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rp2Q9EPK2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rp2Q9EPK2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rp2Q9EPK2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rp2Q9EPK2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rp2Q9EPK2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rp2Q9EPK2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rp2Q9EPK2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rp2Q9EPK2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rp2Q9EPK2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rp2Q9EPK2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rp2Q9EPK2 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rp2Q9EPK2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rp2Q9EPK2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rp2Q9EPK2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rp2Q9EPK2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rp2Q9EPK2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rp2Q9EPK2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rp2Q9EPK2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rp2Q9EPK2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rp2Q9EPK2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rp2Q9EPK2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rp2Q9EPK2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rp2Q9EPK2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rp2Q9EPK2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rp2Q9EPK2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rp2Q9EPK2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rp2Q9EPK2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rp2Q9EPK2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rp2Q9EPK2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rp2Q9EPK2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rp2Q9EPK2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rp2Q9EPK2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rp2Q9EPK2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rp2Q9EPK2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rp2Q9EPK2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rp2Q9EPK2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rp2Q9EPK2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rp2Q9EPK2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rp2Q9EPK2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rp2Q9EPK2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rp2Q9EPK2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rp2Q9EPK2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rp2Q9EPK2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rp2Q9EPK2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rp2Q9EPK2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rp2Q9EPK2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rp2Q9EPK2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rp2Q9EPK2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rp2Q9EPK2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rp2Q9EPK2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rp2Q9EPK2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rp2Q9EPK2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rp2Q9EPK2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rp2Q9EPK2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rp2Q9EPK2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rp2Q9EPK2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rp2Q9EPK2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rp2Q9EPK2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rp2Q9EPK2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rp2Q9EPK2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rp2Q9EPK2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Rp2Q9EPK2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rp2Q9EPK2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rp2Q9EPK2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rp2Q9EPK2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rp2Q9EPK2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rp2Q9EPK2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rp2Q9EPK2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rp2Q9EPK2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rp2Q9EPK2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rp2Q9EPK2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rp2Q9EPK2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rp2Q9EPK2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rp2Q9EPK2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rp2Q9EPK2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rp2Q9EPK2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rp2Q9EPK2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rp2Q9EPK2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms