Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT2

Ndufs3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs3Q9DCT2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ndufs3Q9DCT2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ndufs3Q9DCT2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ndufs3Q9DCT2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ndufs3Q9DCT2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ndufs3Q9DCT2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ndufs3Q9DCT2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ndufs3Q9DCT2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ndufs3Q9DCT2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ndufs3Q9DCT2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ndufs3Q9DCT2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ndufs3Q9DCT2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ndufs3Q9DCT2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ndufs3Q9DCT2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ndufs3Q9DCT2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ndufs3Q9DCT2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ndufs3Q9DCT2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ndufs3Q9DCT2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ndufs3Q9DCT2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ndufs3Q9DCT2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ndufs3Q9DCT2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ndufs3Q9DCT2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ndufs3Q9DCT2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ndufs3Q9DCT2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ndufs3Q9DCT2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ndufs3Q9DCT2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ndufs3Q9DCT2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ndufs3Q9DCT2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ndufs3Q9DCT2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ndufs3Q9DCT2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ndufs3Q9DCT2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ndufs3Q9DCT2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ndufs3Q9DCT2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ndufs3Q9DCT2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ndufs3Q9DCT2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ndufs3Q9DCT2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ndufs3Q9DCT2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ndufs3Q9DCT2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ndufs3Q9DCT2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufs3Q9DCT2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufs3Q9DCT2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufs3Q9DCT2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufs3Q9DCT2 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufs3Q9DCT2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufs3Q9DCT2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufs3Q9DCT2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufs3Q9DCT2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufs3Q9DCT2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufs3Q9DCT2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufs3Q9DCT2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufs3Q9DCT2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufs3Q9DCT2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufs3Q9DCT2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufs3Q9DCT2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufs3Q9DCT2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufs3Q9DCT2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufs3Q9DCT2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufs3Q9DCT2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufs3Q9DCT2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufs3Q9DCT2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufs3Q9DCT2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufs3Q9DCT2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndufs3Q9DCT2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndufs3Q9DCT2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndufs3Q9DCT2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndufs3Q9DCT2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndufs3Q9DCT2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndufs3Q9DCT2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndufs3Q9DCT2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndufs3Q9DCT2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndufs3Q9DCT2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndufs3Q9DCT2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndufs3Q9DCT2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndufs3Q9DCT2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndufs3Q9DCT2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndufs3Q9DCT2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndufs3Q9DCT2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndufs3Q9DCT2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufs3Q9DCT2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufs3Q9DCT2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufs3Q9DCT2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufs3Q9DCT2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufs3Q9DCT2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufs3Q9DCT2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufs3Q9DCT2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufs3Q9DCT2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufs3Q9DCT2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufs3Q9DCT2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufs3Q9DCT2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufs3Q9DCT2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufs3Q9DCT2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufs3Q9DCT2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndufs3Q9DCT2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndufs3Q9DCT2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndufs3Q9DCT2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndufs3Q9DCT2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndufs3Q9DCT2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndufs3Q9DCT2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndufs3Q9DCT2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndufs3Q9DCT2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms