Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH2

Pop7, Ribonuclease P protein subunit p20, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop7Q9DCH2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pop7Q9DCH2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pop7Q9DCH2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pop7Q9DCH2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pop7Q9DCH2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pop7Q9DCH2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pop7Q9DCH2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pop7Q9DCH2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pop7Q9DCH2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Pop7Q9DCH2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pop7Q9DCH2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pop7Q9DCH2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pop7Q9DCH2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pop7Q9DCH2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pop7Q9DCH2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pop7Q9DCH2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pop7Q9DCH2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pop7Q9DCH2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pop7Q9DCH2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pop7Q9DCH2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pop7Q9DCH2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pop7Q9DCH2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pop7Q9DCH2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pop7Q9DCH2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pop7Q9DCH2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pop7Q9DCH2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pop7Q9DCH2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pop7Q9DCH2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pop7Q9DCH2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pop7Q9DCH2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pop7Q9DCH2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pop7Q9DCH2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pop7Q9DCH2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pop7Q9DCH2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pop7Q9DCH2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pop7Q9DCH2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pop7Q9DCH2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pop7Q9DCH2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pop7Q9DCH2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pop7Q9DCH2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pop7Q9DCH2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pop7Q9DCH2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pop7Q9DCH2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pop7Q9DCH2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pop7Q9DCH2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pop7Q9DCH2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pop7Q9DCH2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pop7Q9DCH2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pop7Q9DCH2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pop7Q9DCH2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pop7Q9DCH2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pop7Q9DCH2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pop7Q9DCH2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pop7Q9DCH2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pop7Q9DCH2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pop7Q9DCH2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pop7Q9DCH2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pop7Q9DCH2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pop7Q9DCH2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pop7Q9DCH2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pop7Q9DCH2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pop7Q9DCH2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pop7Q9DCH2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pop7Q9DCH2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pop7Q9DCH2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pop7Q9DCH2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pop7Q9DCH2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pop7Q9DCH2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pop7Q9DCH2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pop7Q9DCH2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pop7Q9DCH2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pop7Q9DCH2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pop7Q9DCH2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Pop7Q9DCH2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pop7Q9DCH2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pop7Q9DCH2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pop7Q9DCH2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pop7Q9DCH2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Pop7Q9DCH2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Pop7Q9DCH2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pop7Q9DCH2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pop7Q9DCH2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pop7Q9DCH2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Pop7Q9DCH2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pop7Q9DCH2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pop7Q9DCH2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pop7Q9DCH2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pop7Q9DCH2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pop7Q9DCH2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pop7Q9DCH2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pop7Q9DCH2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pop7Q9DCH2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pop7Q9DCH2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pop7Q9DCH2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pop7Q9DCH2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pop7Q9DCH2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pop7Q9DCH2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pop7Q9DCH2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pop7Q9DCH2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pop7Q9DCH2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms