Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf6Q9DBU5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf6Q9DBU5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf6Q9DBU5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf6Q9DBU5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf6Q9DBU5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf6Q9DBU5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf6Q9DBU5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf6Q9DBU5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf6Q9DBU5 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf6Q9DBU5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf6Q9DBU5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf6Q9DBU5 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf6Q9DBU5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf6Q9DBU5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf6Q9DBU5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf6Q9DBU5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf6Q9DBU5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf6Q9DBU5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf6Q9DBU5 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnf6Q9DBU5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnf6Q9DBU5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnf6Q9DBU5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnf6Q9DBU5 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnf6Q9DBU5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnf6Q9DBU5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnf6Q9DBU5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnf6Q9DBU5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnf6Q9DBU5 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnf6Q9DBU5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnf6Q9DBU5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnf6Q9DBU5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnf6Q9DBU5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnf6Q9DBU5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnf6Q9DBU5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnf6Q9DBU5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnf6Q9DBU5 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnf6Q9DBU5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnf6Q9DBU5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnf6Q9DBU5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnf6Q9DBU5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnf6Q9DBU5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnf6Q9DBU5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnf6Q9DBU5 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnf6Q9DBU5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnf6Q9DBU5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnf6Q9DBU5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnf6Q9DBU5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnf6Q9DBU5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnf6Q9DBU5 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnf6Q9DBU5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnf6Q9DBU5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnf6Q9DBU5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnf6Q9DBU5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnf6Q9DBU5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnf6Q9DBU5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnf6Q9DBU5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnf6Q9DBU5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnf6Q9DBU5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf6Q9DBU5 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf6Q9DBU5 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf6Q9DBU5 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf6Q9DBU5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf6Q9DBU5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf6Q9DBU5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf6Q9DBU5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf6Q9DBU5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf6Q9DBU5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf6Q9DBU5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf6Q9DBU5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf6Q9DBU5 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf6Q9DBU5 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf6Q9DBU5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf6Q9DBU5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf6Q9DBU5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf6Q9DBU5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf6Q9DBU5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf6Q9DBU5 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf6Q9DBU5 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf6Q9DBU5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf6Q9DBU5 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf6Q9DBU5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf6Q9DBU5 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf6Q9DBU5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf6Q9DBU5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf6Q9DBU5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf6Q9DBU5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf6Q9DBU5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf6Q9DBU5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf6Q9DBU5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf6Q9DBU5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf6Q9DBU5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf6Q9DBU5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf6Q9DBU5 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf6Q9DBU5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf6Q9DBU5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf6Q9DBU5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf6Q9DBU5 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf6Q9DBU5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf6Q9DBU5 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms