Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Riok3Q9DBU3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Riok3Q9DBU3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Riok3Q9DBU3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Riok3Q9DBU3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Riok3Q9DBU3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Riok3Q9DBU3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Riok3Q9DBU3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Riok3Q9DBU3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Riok3Q9DBU3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Riok3Q9DBU3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Riok3Q9DBU3 2900064F13Rik-201ENSMUST00000202166 1008 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Riok3Q9DBU3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Riok3Q9DBU3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Riok3Q9DBU3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Riok3Q9DBU3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Riok3Q9DBU3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Riok3Q9DBU3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Riok3Q9DBU3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Riok3Q9DBU3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Riok3Q9DBU3 Gm25318-201ENSMUST00000122554 314 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Riok3Q9DBU3 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Riok3Q9DBU3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Riok3Q9DBU3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Riok3Q9DBU3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Riok3Q9DBU3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Riok3Q9DBU3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Riok3Q9DBU3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Riok3Q9DBU3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Riok3Q9DBU3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Riok3Q9DBU3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Riok3Q9DBU3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Riok3Q9DBU3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Riok3Q9DBU3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Riok3Q9DBU3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Riok3Q9DBU3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Riok3Q9DBU3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Riok3Q9DBU3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Riok3Q9DBU3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Riok3Q9DBU3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Riok3Q9DBU3 Gm37965-201ENSMUST00000195304 1362 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Riok3Q9DBU3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Riok3Q9DBU3 Gm37629-201ENSMUST00000193635 1050 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Riok3Q9DBU3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Riok3Q9DBU3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Riok3Q9DBU3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Riok3Q9DBU3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Riok3Q9DBU3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Riok3Q9DBU3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Riok3Q9DBU3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Riok3Q9DBU3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Riok3Q9DBU3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Riok3Q9DBU3 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Riok3Q9DBU3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Riok3Q9DBU3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Riok3Q9DBU3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Riok3Q9DBU3 Olfr1397-ps1-201ENSMUST00000121388 962 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Riok3Q9DBU3 Olfr202-202ENSMUST00000201687 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Riok3Q9DBU3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Riok3Q9DBU3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Riok3Q9DBU3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Riok3Q9DBU3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Riok3Q9DBU3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Riok3Q9DBU3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Riok3Q9DBU3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Riok3Q9DBU3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Riok3Q9DBU3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Riok3Q9DBU3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Riok3Q9DBU3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Riok3Q9DBU3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Riok3Q9DBU3 9430065F17Rik-202ENSMUST00000180908 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Riok3Q9DBU3 Gm28975-201ENSMUST00000186412 686 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Riok3Q9DBU3 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Riok3Q9DBU3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Riok3Q9DBU3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Riok3Q9DBU3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Riok3Q9DBU3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Riok3Q9DBU3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Riok3Q9DBU3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Riok3Q9DBU3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Riok3Q9DBU3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Riok3Q9DBU3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Riok3Q9DBU3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Riok3Q9DBU3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Riok3Q9DBU3 Gm3149-203ENSMUST00000179649 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Riok3Q9DBU3 Tcf21-201ENSMUST00000049930 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Riok3Q9DBU3 5930422O12Rik-201ENSMUST00000059351 840 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Riok3Q9DBU3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Riok3Q9DBU3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Riok3Q9DBU3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Riok3Q9DBU3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Riok3Q9DBU3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Riok3Q9DBU3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Riok3Q9DBU3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Riok3Q9DBU3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Riok3Q9DBU3 Gm44863-201ENSMUST00000207613 1422 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Riok3Q9DBU3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Riok3Q9DBU3 Gm12702-201ENSMUST00000123258 612 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Riok3Q9DBU3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Riok3Q9DBU3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms