Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc97Q9DBT3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc97Q9DBT3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc97Q9DBT3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc97Q9DBT3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc97Q9DBT3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc97Q9DBT3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc97Q9DBT3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc97Q9DBT3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc97Q9DBT3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc97Q9DBT3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc97Q9DBT3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc97Q9DBT3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc97Q9DBT3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc97Q9DBT3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc97Q9DBT3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc97Q9DBT3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc97Q9DBT3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc97Q9DBT3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc97Q9DBT3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc97Q9DBT3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc97Q9DBT3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc97Q9DBT3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc97Q9DBT3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc97Q9DBT3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc97Q9DBT3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc97Q9DBT3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc97Q9DBT3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc97Q9DBT3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc97Q9DBT3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc97Q9DBT3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc97Q9DBT3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc97Q9DBT3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc97Q9DBT3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc97Q9DBT3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc97Q9DBT3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc97Q9DBT3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc97Q9DBT3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc97Q9DBT3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc97Q9DBT3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc97Q9DBT3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc97Q9DBT3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc97Q9DBT3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc97Q9DBT3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc97Q9DBT3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc97Q9DBT3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc97Q9DBT3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc97Q9DBT3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc97Q9DBT3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc97Q9DBT3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc97Q9DBT3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc97Q9DBT3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc97Q9DBT3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc97Q9DBT3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc97Q9DBT3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc97Q9DBT3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc97Q9DBT3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc97Q9DBT3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc97Q9DBT3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc97Q9DBT3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc97Q9DBT3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc97Q9DBT3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc97Q9DBT3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc97Q9DBT3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc97Q9DBT3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc97Q9DBT3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc97Q9DBT3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc97Q9DBT3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc97Q9DBT3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc97Q9DBT3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc97Q9DBT3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc97Q9DBT3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc97Q9DBT3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc97Q9DBT3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc97Q9DBT3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc97Q9DBT3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc97Q9DBT3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc97Q9DBT3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc97Q9DBT3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc97Q9DBT3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc97Q9DBT3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc97Q9DBT3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc97Q9DBT3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc97Q9DBT3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc97Q9DBT3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc97Q9DBT3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc97Q9DBT3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc97Q9DBT3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc97Q9DBT3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc97Q9DBT3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc97Q9DBT3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc97Q9DBT3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc97Q9DBT3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc97Q9DBT3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms