Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Swt1Q9DBQ9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Swt1Q9DBQ9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Swt1Q9DBQ9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Swt1Q9DBQ9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Swt1Q9DBQ9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Swt1Q9DBQ9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Swt1Q9DBQ9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Swt1Q9DBQ9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Swt1Q9DBQ9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Swt1Q9DBQ9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Swt1Q9DBQ9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Swt1Q9DBQ9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Swt1Q9DBQ9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Swt1Q9DBQ9 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Swt1Q9DBQ9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Swt1Q9DBQ9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Swt1Q9DBQ9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Swt1Q9DBQ9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Swt1Q9DBQ9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Swt1Q9DBQ9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Swt1Q9DBQ9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Swt1Q9DBQ9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Swt1Q9DBQ9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Swt1Q9DBQ9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Swt1Q9DBQ9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Swt1Q9DBQ9 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Swt1Q9DBQ9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Swt1Q9DBQ9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Swt1Q9DBQ9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Swt1Q9DBQ9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Swt1Q9DBQ9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Swt1Q9DBQ9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Swt1Q9DBQ9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Swt1Q9DBQ9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Swt1Q9DBQ9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Swt1Q9DBQ9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Swt1Q9DBQ9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Swt1Q9DBQ9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Swt1Q9DBQ9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Swt1Q9DBQ9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Swt1Q9DBQ9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Swt1Q9DBQ9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Swt1Q9DBQ9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Swt1Q9DBQ9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Swt1Q9DBQ9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Swt1Q9DBQ9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Swt1Q9DBQ9 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Swt1Q9DBQ9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Swt1Q9DBQ9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Swt1Q9DBQ9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Swt1Q9DBQ9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Swt1Q9DBQ9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Swt1Q9DBQ9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Swt1Q9DBQ9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Swt1Q9DBQ9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Swt1Q9DBQ9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Swt1Q9DBQ9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Swt1Q9DBQ9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Swt1Q9DBQ9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Swt1Q9DBQ9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Swt1Q9DBQ9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Swt1Q9DBQ9 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Swt1Q9DBQ9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Swt1Q9DBQ9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Swt1Q9DBQ9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Swt1Q9DBQ9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Swt1Q9DBQ9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Swt1Q9DBQ9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Swt1Q9DBQ9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Swt1Q9DBQ9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Swt1Q9DBQ9 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Swt1Q9DBQ9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Swt1Q9DBQ9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Swt1Q9DBQ9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Swt1Q9DBQ9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Swt1Q9DBQ9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Swt1Q9DBQ9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Swt1Q9DBQ9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Swt1Q9DBQ9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Swt1Q9DBQ9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Swt1Q9DBQ9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Swt1Q9DBQ9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Swt1Q9DBQ9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Swt1Q9DBQ9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Swt1Q9DBQ9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Swt1Q9DBQ9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Swt1Q9DBQ9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Swt1Q9DBQ9 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Swt1Q9DBQ9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Swt1Q9DBQ9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Swt1Q9DBQ9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Swt1Q9DBQ9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Swt1Q9DBQ9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Swt1Q9DBQ9 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Swt1Q9DBQ9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Swt1Q9DBQ9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Swt1Q9DBQ9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Swt1Q9DBQ9 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Swt1Q9DBQ9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms