Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBE9

Ftsj3, pre-rRNA processing protein FTSJ3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ftsj3Q9DBE9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ftsj3Q9DBE9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ftsj3Q9DBE9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ftsj3Q9DBE9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ftsj3Q9DBE9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ftsj3Q9DBE9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ftsj3Q9DBE9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ftsj3Q9DBE9 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ftsj3Q9DBE9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ftsj3Q9DBE9 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ftsj3Q9DBE9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ftsj3Q9DBE9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ftsj3Q9DBE9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ftsj3Q9DBE9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ftsj3Q9DBE9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ftsj3Q9DBE9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ftsj3Q9DBE9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ftsj3Q9DBE9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ftsj3Q9DBE9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ftsj3Q9DBE9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ftsj3Q9DBE9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ftsj3Q9DBE9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ftsj3Q9DBE9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ftsj3Q9DBE9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ftsj3Q9DBE9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ftsj3Q9DBE9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ftsj3Q9DBE9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ftsj3Q9DBE9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ftsj3Q9DBE9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ftsj3Q9DBE9 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ftsj3Q9DBE9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ftsj3Q9DBE9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ftsj3Q9DBE9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ftsj3Q9DBE9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ftsj3Q9DBE9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ftsj3Q9DBE9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ftsj3Q9DBE9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ftsj3Q9DBE9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ftsj3Q9DBE9 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ftsj3Q9DBE9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ftsj3Q9DBE9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ftsj3Q9DBE9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ftsj3Q9DBE9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ftsj3Q9DBE9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ftsj3Q9DBE9 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ftsj3Q9DBE9 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ftsj3Q9DBE9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ftsj3Q9DBE9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ftsj3Q9DBE9 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ftsj3Q9DBE9 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ftsj3Q9DBE9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ftsj3Q9DBE9 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ftsj3Q9DBE9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ftsj3Q9DBE9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ftsj3Q9DBE9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ftsj3Q9DBE9 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ftsj3Q9DBE9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ftsj3Q9DBE9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ftsj3Q9DBE9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ftsj3Q9DBE9 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ftsj3Q9DBE9 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ftsj3Q9DBE9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ftsj3Q9DBE9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ftsj3Q9DBE9 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ftsj3Q9DBE9 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ftsj3Q9DBE9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ftsj3Q9DBE9 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ftsj3Q9DBE9 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ftsj3Q9DBE9 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ftsj3Q9DBE9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ftsj3Q9DBE9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ftsj3Q9DBE9 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ftsj3Q9DBE9 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ftsj3Q9DBE9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ftsj3Q9DBE9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ftsj3Q9DBE9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Ftsj3Q9DBE9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ftsj3Q9DBE9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ftsj3Q9DBE9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ftsj3Q9DBE9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ftsj3Q9DBE9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ftsj3Q9DBE9 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ftsj3Q9DBE9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ftsj3Q9DBE9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ftsj3Q9DBE9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ftsj3Q9DBE9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ftsj3Q9DBE9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ftsj3Q9DBE9 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ftsj3Q9DBE9 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ftsj3Q9DBE9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ftsj3Q9DBE9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ftsj3Q9DBE9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ftsj3Q9DBE9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ftsj3Q9DBE9 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ftsj3Q9DBE9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ftsj3Q9DBE9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ftsj3Q9DBE9 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ftsj3Q9DBE9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ftsj3Q9DBE9 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ftsj3Q9DBE9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.9 ms