Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBA6

Tysnd1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tysnd1Q9DBA6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tysnd1Q9DBA6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tysnd1Q9DBA6 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tysnd1Q9DBA6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tysnd1Q9DBA6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tysnd1Q9DBA6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tysnd1Q9DBA6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tysnd1Q9DBA6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tysnd1Q9DBA6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tysnd1Q9DBA6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tysnd1Q9DBA6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tysnd1Q9DBA6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tysnd1Q9DBA6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tysnd1Q9DBA6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tysnd1Q9DBA6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tysnd1Q9DBA6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tysnd1Q9DBA6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tysnd1Q9DBA6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tysnd1Q9DBA6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tysnd1Q9DBA6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tysnd1Q9DBA6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tysnd1Q9DBA6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tysnd1Q9DBA6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tysnd1Q9DBA6 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tysnd1Q9DBA6 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tysnd1Q9DBA6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tysnd1Q9DBA6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tysnd1Q9DBA6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tysnd1Q9DBA6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tysnd1Q9DBA6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tysnd1Q9DBA6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tysnd1Q9DBA6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tysnd1Q9DBA6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tysnd1Q9DBA6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tysnd1Q9DBA6 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tysnd1Q9DBA6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tysnd1Q9DBA6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tysnd1Q9DBA6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tysnd1Q9DBA6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tysnd1Q9DBA6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tysnd1Q9DBA6 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tysnd1Q9DBA6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tysnd1Q9DBA6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tysnd1Q9DBA6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tysnd1Q9DBA6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tysnd1Q9DBA6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tysnd1Q9DBA6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tysnd1Q9DBA6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tysnd1Q9DBA6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tysnd1Q9DBA6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tysnd1Q9DBA6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Tysnd1Q9DBA6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Tysnd1Q9DBA6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms