Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Fundc1Q9DB70 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fundc1Q9DB70 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fundc1Q9DB70 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Fundc1Q9DB70 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fundc1Q9DB70 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fundc1Q9DB70 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Fundc1Q9DB70 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fundc1Q9DB70 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fundc1Q9DB70 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fundc1Q9DB70 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fundc1Q9DB70 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fundc1Q9DB70 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fundc1Q9DB70 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fundc1Q9DB70 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fundc1Q9DB70 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fundc1Q9DB70 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fundc1Q9DB70 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fundc1Q9DB70 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fundc1Q9DB70 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fundc1Q9DB70 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fundc1Q9DB70 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fundc1Q9DB70 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fundc1Q9DB70 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fundc1Q9DB70 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fundc1Q9DB70 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fundc1Q9DB70 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fundc1Q9DB70 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fundc1Q9DB70 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fundc1Q9DB70 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fundc1Q9DB70 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Fundc1Q9DB70 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Fundc1Q9DB70 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fundc1Q9DB70 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fundc1Q9DB70 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fundc1Q9DB70 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fundc1Q9DB70 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fundc1Q9DB70 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fundc1Q9DB70 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fundc1Q9DB70 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fundc1Q9DB70 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fundc1Q9DB70 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fundc1Q9DB70 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fundc1Q9DB70 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fundc1Q9DB70 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fundc1Q9DB70 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fundc1Q9DB70 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fundc1Q9DB70 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fundc1Q9DB70 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fundc1Q9DB70 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fundc1Q9DB70 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fundc1Q9DB70 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fundc1Q9DB70 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fundc1Q9DB70 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fundc1Q9DB70 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fundc1Q9DB70 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fundc1Q9DB70 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fundc1Q9DB70 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fundc1Q9DB70 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fundc1Q9DB70 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fundc1Q9DB70 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fundc1Q9DB70 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fundc1Q9DB70 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fundc1Q9DB70 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fundc1Q9DB70 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fundc1Q9DB70 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Fundc1Q9DB70 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Fundc1Q9DB70 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Fundc1Q9DB70 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Fundc1Q9DB70 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fundc1Q9DB70 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fundc1Q9DB70 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fundc1Q9DB70 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fundc1Q9DB70 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fundc1Q9DB70 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fundc1Q9DB70 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fundc1Q9DB70 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fundc1Q9DB70 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fundc1Q9DB70 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fundc1Q9DB70 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fundc1Q9DB70 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fundc1Q9DB70 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fundc1Q9DB70 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fundc1Q9DB70 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fundc1Q9DB70 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fundc1Q9DB70 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fundc1Q9DB70 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fundc1Q9DB70 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fundc1Q9DB70 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fundc1Q9DB70 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fundc1Q9DB70 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fundc1Q9DB70 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fundc1Q9DB70 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fundc1Q9DB70 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fundc1Q9DB70 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fundc1Q9DB70 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fundc1Q9DB70 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fundc1Q9DB70 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fundc1Q9DB70 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fundc1Q9DB70 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms