Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pop5Q9DB28 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pop5Q9DB28 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pop5Q9DB28 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pop5Q9DB28 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pop5Q9DB28 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pop5Q9DB28 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pop5Q9DB28 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pop5Q9DB28 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pop5Q9DB28 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pop5Q9DB28 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pop5Q9DB28 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pop5Q9DB28 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pop5Q9DB28 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pop5Q9DB28 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pop5Q9DB28 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pop5Q9DB28 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pop5Q9DB28 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pop5Q9DB28 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pop5Q9DB28 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pop5Q9DB28 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pop5Q9DB28 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pop5Q9DB28 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pop5Q9DB28 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pop5Q9DB28 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pop5Q9DB28 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pop5Q9DB28 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pop5Q9DB28 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pop5Q9DB28 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pop5Q9DB28 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pop5Q9DB28 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pop5Q9DB28 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pop5Q9DB28 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pop5Q9DB28 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pop5Q9DB28 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pop5Q9DB28 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pop5Q9DB28 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pop5Q9DB28 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pop5Q9DB28 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pop5Q9DB28 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pop5Q9DB28 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pop5Q9DB28 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pop5Q9DB28 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pop5Q9DB28 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pop5Q9DB28 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pop5Q9DB28 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pop5Q9DB28 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pop5Q9DB28 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pop5Q9DB28 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pop5Q9DB28 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pop5Q9DB28 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pop5Q9DB28 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pop5Q9DB28 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pop5Q9DB28 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pop5Q9DB28 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pop5Q9DB28 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pop5Q9DB28 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pop5Q9DB28 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pop5Q9DB28 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pop5Q9DB28 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pop5Q9DB28 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pop5Q9DB28 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pop5Q9DB28 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pop5Q9DB28 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pop5Q9DB28 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pop5Q9DB28 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pop5Q9DB28 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pop5Q9DB28 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pop5Q9DB28 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pop5Q9DB28 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Pop5Q9DB28 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Pop5Q9DB28 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pop5Q9DB28 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pop5Q9DB28 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pop5Q9DB28 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pop5Q9DB28 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pop5Q9DB28 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pop5Q9DB28 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pop5Q9DB28 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pop5Q9DB28 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pop5Q9DB28 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pop5Q9DB28 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pop5Q9DB28 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pop5Q9DB28 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pop5Q9DB28 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pop5Q9DB28 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pop5Q9DB28 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pop5Q9DB28 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pop5Q9DB28 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pop5Q9DB28 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pop5Q9DB28 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pop5Q9DB28 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pop5Q9DB28 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pop5Q9DB28 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pop5Q9DB28 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pop5Q9DB28 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pop5Q9DB28 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pop5Q9DB28 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pop5Q9DB28 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pop5Q9DB28 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms