Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA37

Samd8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd8Q9DA37 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd8Q9DA37 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd8Q9DA37 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd8Q9DA37 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd8Q9DA37 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd8Q9DA37 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd8Q9DA37 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd8Q9DA37 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd8Q9DA37 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd8Q9DA37 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd8Q9DA37 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd8Q9DA37 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd8Q9DA37 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd8Q9DA37 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd8Q9DA37 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd8Q9DA37 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd8Q9DA37 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd8Q9DA37 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd8Q9DA37 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd8Q9DA37 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd8Q9DA37 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd8Q9DA37 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd8Q9DA37 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd8Q9DA37 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd8Q9DA37 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd8Q9DA37 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd8Q9DA37 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd8Q9DA37 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd8Q9DA37 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd8Q9DA37 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd8Q9DA37 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd8Q9DA37 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd8Q9DA37 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd8Q9DA37 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd8Q9DA37 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd8Q9DA37 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd8Q9DA37 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd8Q9DA37 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd8Q9DA37 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd8Q9DA37 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd8Q9DA37 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd8Q9DA37 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd8Q9DA37 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd8Q9DA37 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd8Q9DA37 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd8Q9DA37 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd8Q9DA37 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd8Q9DA37 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd8Q9DA37 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd8Q9DA37 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd8Q9DA37 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd8Q9DA37 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd8Q9DA37 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd8Q9DA37 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd8Q9DA37 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd8Q9DA37 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd8Q9DA37 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd8Q9DA37 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samd8Q9DA37 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samd8Q9DA37 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samd8Q9DA37 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samd8Q9DA37 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samd8Q9DA37 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samd8Q9DA37 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samd8Q9DA37 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samd8Q9DA37 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samd8Q9DA37 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samd8Q9DA37 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samd8Q9DA37 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samd8Q9DA37 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samd8Q9DA37 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samd8Q9DA37 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samd8Q9DA37 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samd8Q9DA37 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samd8Q9DA37 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samd8Q9DA37 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samd8Q9DA37 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samd8Q9DA37 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samd8Q9DA37 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samd8Q9DA37 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samd8Q9DA37 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samd8Q9DA37 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samd8Q9DA37 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samd8Q9DA37 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samd8Q9DA37 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samd8Q9DA37 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samd8Q9DA37 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samd8Q9DA37 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samd8Q9DA37 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samd8Q9DA37 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samd8Q9DA37 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samd8Q9DA37 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samd8Q9DA37 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samd8Q9DA37 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Samd8Q9DA37 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samd8Q9DA37 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samd8Q9DA37 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Samd8Q9DA37 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Samd8Q9DA37 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Samd8Q9DA37 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.5 ms