Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rpl4Q9D8E6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rpl4Q9D8E6 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rpl4Q9D8E6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rpl4Q9D8E6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rpl4Q9D8E6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpl4Q9D8E6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpl4Q9D8E6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpl4Q9D8E6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpl4Q9D8E6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpl4Q9D8E6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpl4Q9D8E6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpl4Q9D8E6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpl4Q9D8E6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpl4Q9D8E6 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpl4Q9D8E6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpl4Q9D8E6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpl4Q9D8E6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpl4Q9D8E6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpl4Q9D8E6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpl4Q9D8E6 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rpl4Q9D8E6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rpl4Q9D8E6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rpl4Q9D8E6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rpl4Q9D8E6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rpl4Q9D8E6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rpl4Q9D8E6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rpl4Q9D8E6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rpl4Q9D8E6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rpl4Q9D8E6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rpl4Q9D8E6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rpl4Q9D8E6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Rpl4Q9D8E6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rpl4Q9D8E6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rpl4Q9D8E6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rpl4Q9D8E6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rpl4Q9D8E6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rpl4Q9D8E6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rpl4Q9D8E6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rpl4Q9D8E6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rpl4Q9D8E6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rpl4Q9D8E6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rpl4Q9D8E6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rpl4Q9D8E6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rpl4Q9D8E6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rpl4Q9D8E6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rpl4Q9D8E6 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Rpl4Q9D8E6 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rpl4Q9D8E6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rpl4Q9D8E6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rpl4Q9D8E6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rpl4Q9D8E6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rpl4Q9D8E6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rpl4Q9D8E6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rpl4Q9D8E6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rpl4Q9D8E6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rpl4Q9D8E6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rpl4Q9D8E6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rpl4Q9D8E6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rpl4Q9D8E6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rpl4Q9D8E6 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rpl4Q9D8E6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rpl4Q9D8E6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rpl4Q9D8E6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rpl4Q9D8E6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpl4Q9D8E6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpl4Q9D8E6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpl4Q9D8E6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpl4Q9D8E6 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpl4Q9D8E6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpl4Q9D8E6 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpl4Q9D8E6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpl4Q9D8E6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpl4Q9D8E6 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpl4Q9D8E6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpl4Q9D8E6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpl4Q9D8E6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpl4Q9D8E6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpl4Q9D8E6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpl4Q9D8E6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rpl4Q9D8E6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rpl4Q9D8E6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rpl4Q9D8E6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rpl4Q9D8E6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rpl4Q9D8E6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rpl4Q9D8E6 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rpl4Q9D8E6 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rpl4Q9D8E6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rpl4Q9D8E6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rpl4Q9D8E6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rpl4Q9D8E6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpl4Q9D8E6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpl4Q9D8E6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpl4Q9D8E6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpl4Q9D8E6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpl4Q9D8E6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpl4Q9D8E6 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpl4Q9D8E6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpl4Q9D8E6 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpl4Q9D8E6 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms