Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B7

Jam3, Junctional adhesion molecule C, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jam3Q9D8B7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Jam3Q9D8B7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Jam3Q9D8B7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Jam3Q9D8B7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Jam3Q9D8B7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Jam3Q9D8B7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Jam3Q9D8B7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Jam3Q9D8B7 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Jam3Q9D8B7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Jam3Q9D8B7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Jam3Q9D8B7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Jam3Q9D8B7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Jam3Q9D8B7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Jam3Q9D8B7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Jam3Q9D8B7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Jam3Q9D8B7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Jam3Q9D8B7 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Jam3Q9D8B7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Jam3Q9D8B7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Jam3Q9D8B7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Jam3Q9D8B7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Jam3Q9D8B7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Jam3Q9D8B7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Jam3Q9D8B7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Jam3Q9D8B7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Jam3Q9D8B7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Jam3Q9D8B7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Jam3Q9D8B7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Jam3Q9D8B7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms