Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chmp4bQ9D8B3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chmp4bQ9D8B3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chmp4bQ9D8B3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chmp4bQ9D8B3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chmp4bQ9D8B3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chmp4bQ9D8B3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chmp4bQ9D8B3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chmp4bQ9D8B3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Chmp4bQ9D8B3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chmp4bQ9D8B3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Chmp4bQ9D8B3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chmp4bQ9D8B3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chmp4bQ9D8B3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chmp4bQ9D8B3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chmp4bQ9D8B3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chmp4bQ9D8B3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chmp4bQ9D8B3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chmp4bQ9D8B3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chmp4bQ9D8B3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chmp4bQ9D8B3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chmp4bQ9D8B3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chmp4bQ9D8B3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chmp4bQ9D8B3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chmp4bQ9D8B3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Chmp4bQ9D8B3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chmp4bQ9D8B3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Chmp4bQ9D8B3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chmp4bQ9D8B3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chmp4bQ9D8B3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chmp4bQ9D8B3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chmp4bQ9D8B3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Chmp4bQ9D8B3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Chmp4bQ9D8B3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Chmp4bQ9D8B3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Chmp4bQ9D8B3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Chmp4bQ9D8B3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Chmp4bQ9D8B3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Chmp4bQ9D8B3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Chmp4bQ9D8B3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Chmp4bQ9D8B3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Chmp4bQ9D8B3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chmp4bQ9D8B3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chmp4bQ9D8B3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Chmp4bQ9D8B3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chmp4bQ9D8B3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chmp4bQ9D8B3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chmp4bQ9D8B3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chmp4bQ9D8B3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chmp4bQ9D8B3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chmp4bQ9D8B3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chmp4bQ9D8B3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chmp4bQ9D8B3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chmp4bQ9D8B3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chmp4bQ9D8B3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chmp4bQ9D8B3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chmp4bQ9D8B3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chmp4bQ9D8B3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chmp4bQ9D8B3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chmp4bQ9D8B3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chmp4bQ9D8B3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chmp4bQ9D8B3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chmp4bQ9D8B3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chmp4bQ9D8B3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chmp4bQ9D8B3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chmp4bQ9D8B3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chmp4bQ9D8B3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chmp4bQ9D8B3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chmp4bQ9D8B3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chmp4bQ9D8B3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chmp4bQ9D8B3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chmp4bQ9D8B3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chmp4bQ9D8B3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chmp4bQ9D8B3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chmp4bQ9D8B3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chmp4bQ9D8B3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chmp4bQ9D8B3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chmp4bQ9D8B3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chmp4bQ9D8B3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chmp4bQ9D8B3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chmp4bQ9D8B3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chmp4bQ9D8B3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chmp4bQ9D8B3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chmp4bQ9D8B3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chmp4bQ9D8B3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Chmp4bQ9D8B3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chmp4bQ9D8B3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chmp4bQ9D8B3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chmp4bQ9D8B3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chmp4bQ9D8B3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chmp4bQ9D8B3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chmp4bQ9D8B3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chmp4bQ9D8B3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chmp4bQ9D8B3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Chmp4bQ9D8B3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chmp4bQ9D8B3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chmp4bQ9D8B3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chmp4bQ9D8B3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chmp4bQ9D8B3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chmp4bQ9D8B3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms