Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7A6

Srp19, Signal recognition particle 19 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp19Q9D7A6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Srp19Q9D7A6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Srp19Q9D7A6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Srp19Q9D7A6 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srp19Q9D7A6 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srp19Q9D7A6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srp19Q9D7A6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srp19Q9D7A6 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srp19Q9D7A6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srp19Q9D7A6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srp19Q9D7A6 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Srp19Q9D7A6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Srp19Q9D7A6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Srp19Q9D7A6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Srp19Q9D7A6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srp19Q9D7A6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Srp19Q9D7A6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srp19Q9D7A6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Srp19Q9D7A6 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srp19Q9D7A6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srp19Q9D7A6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srp19Q9D7A6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srp19Q9D7A6 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srp19Q9D7A6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srp19Q9D7A6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srp19Q9D7A6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srp19Q9D7A6 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srp19Q9D7A6 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srp19Q9D7A6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Srp19Q9D7A6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Srp19Q9D7A6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Srp19Q9D7A6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srp19Q9D7A6 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srp19Q9D7A6 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srp19Q9D7A6 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srp19Q9D7A6 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srp19Q9D7A6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srp19Q9D7A6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Srp19Q9D7A6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Srp19Q9D7A6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Srp19Q9D7A6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Srp19Q9D7A6 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Srp19Q9D7A6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Srp19Q9D7A6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srp19Q9D7A6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Srp19Q9D7A6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srp19Q9D7A6 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srp19Q9D7A6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Srp19Q9D7A6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srp19Q9D7A6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srp19Q9D7A6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Srp19Q9D7A6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Srp19Q9D7A6 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Srp19Q9D7A6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srp19Q9D7A6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Srp19Q9D7A6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srp19Q9D7A6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srp19Q9D7A6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srp19Q9D7A6 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srp19Q9D7A6 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srp19Q9D7A6 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srp19Q9D7A6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srp19Q9D7A6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srp19Q9D7A6 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srp19Q9D7A6 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srp19Q9D7A6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srp19Q9D7A6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srp19Q9D7A6 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srp19Q9D7A6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srp19Q9D7A6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srp19Q9D7A6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srp19Q9D7A6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srp19Q9D7A6 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srp19Q9D7A6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srp19Q9D7A6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Srp19Q9D7A6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Srp19Q9D7A6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Srp19Q9D7A6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srp19Q9D7A6 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srp19Q9D7A6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srp19Q9D7A6 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srp19Q9D7A6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srp19Q9D7A6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srp19Q9D7A6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srp19Q9D7A6 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srp19Q9D7A6 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srp19Q9D7A6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srp19Q9D7A6 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srp19Q9D7A6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srp19Q9D7A6 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srp19Q9D7A6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Srp19Q9D7A6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Srp19Q9D7A6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Srp19Q9D7A6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Srp19Q9D7A6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Srp19Q9D7A6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Srp19Q9D7A6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srp19Q9D7A6 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srp19Q9D7A6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srp19Q9D7A6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms