Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsraQ9D6Y7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MsraQ9D6Y7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MsraQ9D6Y7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MsraQ9D6Y7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MsraQ9D6Y7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MsraQ9D6Y7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MsraQ9D6Y7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MsraQ9D6Y7 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MsraQ9D6Y7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MsraQ9D6Y7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MsraQ9D6Y7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MsraQ9D6Y7 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
MsraQ9D6Y7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
MsraQ9D6Y7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MsraQ9D6Y7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
MsraQ9D6Y7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MsraQ9D6Y7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MsraQ9D6Y7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MsraQ9D6Y7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MsraQ9D6Y7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MsraQ9D6Y7 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MsraQ9D6Y7 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
MsraQ9D6Y7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MsraQ9D6Y7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MsraQ9D6Y7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MsraQ9D6Y7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MsraQ9D6Y7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MsraQ9D6Y7 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MsraQ9D6Y7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MsraQ9D6Y7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MsraQ9D6Y7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MsraQ9D6Y7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MsraQ9D6Y7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MsraQ9D6Y7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MsraQ9D6Y7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MsraQ9D6Y7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MsraQ9D6Y7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MsraQ9D6Y7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
MsraQ9D6Y7 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MsraQ9D6Y7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
MsraQ9D6Y7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MsraQ9D6Y7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MsraQ9D6Y7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MsraQ9D6Y7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MsraQ9D6Y7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MsraQ9D6Y7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
MsraQ9D6Y7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MsraQ9D6Y7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MsraQ9D6Y7 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MsraQ9D6Y7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MsraQ9D6Y7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MsraQ9D6Y7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MsraQ9D6Y7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MsraQ9D6Y7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MsraQ9D6Y7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MsraQ9D6Y7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MsraQ9D6Y7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MsraQ9D6Y7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MsraQ9D6Y7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MsraQ9D6Y7 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MsraQ9D6Y7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
MsraQ9D6Y7 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MsraQ9D6Y7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MsraQ9D6Y7 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MsraQ9D6Y7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MsraQ9D6Y7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MsraQ9D6Y7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MsraQ9D6Y7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MsraQ9D6Y7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MsraQ9D6Y7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MsraQ9D6Y7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MsraQ9D6Y7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MsraQ9D6Y7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MsraQ9D6Y7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MsraQ9D6Y7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MsraQ9D6Y7 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MsraQ9D6Y7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MsraQ9D6Y7 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MsraQ9D6Y7 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
MsraQ9D6Y7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MsraQ9D6Y7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MsraQ9D6Y7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MsraQ9D6Y7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MsraQ9D6Y7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MsraQ9D6Y7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MsraQ9D6Y7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MsraQ9D6Y7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MsraQ9D6Y7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MsraQ9D6Y7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MsraQ9D6Y7 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MsraQ9D6Y7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MsraQ9D6Y7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MsraQ9D6Y7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MsraQ9D6Y7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MsraQ9D6Y7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MsraQ9D6Y7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MsraQ9D6Y7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MsraQ9D6Y7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MsraQ9D6Y7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MsraQ9D6Y7 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms