Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G3

2900055J20Rik, RIKEN cDNA 2900055J20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2900055J20RikQ9D6G3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
2900055J20RikQ9D6G3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms