Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Rab11fip1Q9D620 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rab11fip1Q9D620 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Rab11fip1Q9D620 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rab11fip1Q9D620 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Rab11fip1Q9D620 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Rab11fip1Q9D620 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Rab11fip1Q9D620 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rab11fip1Q9D620 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
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Rab11fip1Q9D620 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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Rab11fip1Q9D620 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rab11fip1Q9D620 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rab11fip1Q9D620 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rab11fip1Q9D620 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rab11fip1Q9D620 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rab11fip1Q9D620 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rab11fip1Q9D620 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rab11fip1Q9D620 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rab11fip1Q9D620 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rab11fip1Q9D620 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rab11fip1Q9D620 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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Rab11fip1Q9D620 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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