Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U0

Lpcat2b, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 2B, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lpcat2bQ9D5U0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Lpcat2bQ9D5U0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lpcat2bQ9D5U0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lpcat2bQ9D5U0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lpcat2bQ9D5U0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lpcat2bQ9D5U0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lpcat2bQ9D5U0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lpcat2bQ9D5U0 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lpcat2bQ9D5U0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lpcat2bQ9D5U0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lpcat2bQ9D5U0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lpcat2bQ9D5U0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lpcat2bQ9D5U0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lpcat2bQ9D5U0 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lpcat2bQ9D5U0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lpcat2bQ9D5U0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lpcat2bQ9D5U0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lpcat2bQ9D5U0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lpcat2bQ9D5U0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lpcat2bQ9D5U0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lpcat2bQ9D5U0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lpcat2bQ9D5U0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lpcat2bQ9D5U0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lpcat2bQ9D5U0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lpcat2bQ9D5U0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lpcat2bQ9D5U0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lpcat2bQ9D5U0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lpcat2bQ9D5U0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lpcat2bQ9D5U0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Lpcat2bQ9D5U0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Lpcat2bQ9D5U0 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
Lpcat2bQ9D5U0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lpcat2bQ9D5U0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lpcat2bQ9D5U0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lpcat2bQ9D5U0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lpcat2bQ9D5U0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lpcat2bQ9D5U0 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lpcat2bQ9D5U0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lpcat2bQ9D5U0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lpcat2bQ9D5U0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lpcat2bQ9D5U0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Lpcat2bQ9D5U0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lpcat2bQ9D5U0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lpcat2bQ9D5U0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lpcat2bQ9D5U0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lpcat2bQ9D5U0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lpcat2bQ9D5U0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lpcat2bQ9D5U0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lpcat2bQ9D5U0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lpcat2bQ9D5U0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lpcat2bQ9D5U0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lpcat2bQ9D5U0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lpcat2bQ9D5U0 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lpcat2bQ9D5U0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lpcat2bQ9D5U0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lpcat2bQ9D5U0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lpcat2bQ9D5U0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lpcat2bQ9D5U0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lpcat2bQ9D5U0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lpcat2bQ9D5U0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lpcat2bQ9D5U0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lpcat2bQ9D5U0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lpcat2bQ9D5U0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Lpcat2bQ9D5U0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lpcat2bQ9D5U0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lpcat2bQ9D5U0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Lpcat2bQ9D5U0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lpcat2bQ9D5U0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lpcat2bQ9D5U0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lpcat2bQ9D5U0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lpcat2bQ9D5U0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lpcat2bQ9D5U0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lpcat2bQ9D5U0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lpcat2bQ9D5U0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Lpcat2bQ9D5U0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lpcat2bQ9D5U0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lpcat2bQ9D5U0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lpcat2bQ9D5U0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lpcat2bQ9D5U0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lpcat2bQ9D5U0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lpcat2bQ9D5U0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lpcat2bQ9D5U0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lpcat2bQ9D5U0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lpcat2bQ9D5U0 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lpcat2bQ9D5U0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lpcat2bQ9D5U0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lpcat2bQ9D5U0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lpcat2bQ9D5U0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lpcat2bQ9D5U0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lpcat2bQ9D5U0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lpcat2bQ9D5U0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lpcat2bQ9D5U0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lpcat2bQ9D5U0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lpcat2bQ9D5U0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lpcat2bQ9D5U0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lpcat2bQ9D5U0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lpcat2bQ9D5U0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lpcat2bQ9D5U0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lpcat2bQ9D5U0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lpcat2bQ9D5U0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms