Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sf3a3Q9D554 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sf3a3Q9D554 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sf3a3Q9D554 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sf3a3Q9D554 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sf3a3Q9D554 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sf3a3Q9D554 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sf3a3Q9D554 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sf3a3Q9D554 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sf3a3Q9D554 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sf3a3Q9D554 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sf3a3Q9D554 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sf3a3Q9D554 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sf3a3Q9D554 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sf3a3Q9D554 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sf3a3Q9D554 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sf3a3Q9D554 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sf3a3Q9D554 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sf3a3Q9D554 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sf3a3Q9D554 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sf3a3Q9D554 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sf3a3Q9D554 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sf3a3Q9D554 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sf3a3Q9D554 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sf3a3Q9D554 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sf3a3Q9D554 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Sf3a3Q9D554 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sf3a3Q9D554 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sf3a3Q9D554 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sf3a3Q9D554 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sf3a3Q9D554 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sf3a3Q9D554 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sf3a3Q9D554 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sf3a3Q9D554 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sf3a3Q9D554 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sf3a3Q9D554 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sf3a3Q9D554 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Sf3a3Q9D554 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sf3a3Q9D554 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sf3a3Q9D554 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sf3a3Q9D554 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sf3a3Q9D554 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sf3a3Q9D554 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sf3a3Q9D554 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sf3a3Q9D554 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sf3a3Q9D554 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sf3a3Q9D554 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sf3a3Q9D554 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sf3a3Q9D554 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Sf3a3Q9D554 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sf3a3Q9D554 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sf3a3Q9D554 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sf3a3Q9D554 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sf3a3Q9D554 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sf3a3Q9D554 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sf3a3Q9D554 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sf3a3Q9D554 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sf3a3Q9D554 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sf3a3Q9D554 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sf3a3Q9D554 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sf3a3Q9D554 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sf3a3Q9D554 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sf3a3Q9D554 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sf3a3Q9D554 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sf3a3Q9D554 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sf3a3Q9D554 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sf3a3Q9D554 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sf3a3Q9D554 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sf3a3Q9D554 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sf3a3Q9D554 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sf3a3Q9D554 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sf3a3Q9D554 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sf3a3Q9D554 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sf3a3Q9D554 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sf3a3Q9D554 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sf3a3Q9D554 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sf3a3Q9D554 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sf3a3Q9D554 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sf3a3Q9D554 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sf3a3Q9D554 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sf3a3Q9D554 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sf3a3Q9D554 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sf3a3Q9D554 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sf3a3Q9D554 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Sf3a3Q9D554 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Sf3a3Q9D554 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sf3a3Q9D554 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sf3a3Q9D554 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sf3a3Q9D554 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sf3a3Q9D554 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sf3a3Q9D554 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sf3a3Q9D554 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sf3a3Q9D554 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sf3a3Q9D554 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sf3a3Q9D554 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sf3a3Q9D554 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sf3a3Q9D554 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sf3a3Q9D554 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sf3a3Q9D554 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sf3a3Q9D554 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms