Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Y3

Rhox2a, Reproductive homeobox 2A, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox2aQ9D4Y3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhox2aQ9D4Y3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhox2aQ9D4Y3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhox2aQ9D4Y3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhox2aQ9D4Y3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhox2aQ9D4Y3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhox2aQ9D4Y3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhox2aQ9D4Y3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhox2aQ9D4Y3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhox2aQ9D4Y3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhox2aQ9D4Y3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhox2aQ9D4Y3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhox2aQ9D4Y3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhox2aQ9D4Y3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhox2aQ9D4Y3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhox2aQ9D4Y3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhox2aQ9D4Y3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhox2aQ9D4Y3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhox2aQ9D4Y3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rhox2aQ9D4Y3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rhox2aQ9D4Y3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rhox2aQ9D4Y3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rhox2aQ9D4Y3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rhox2aQ9D4Y3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rhox2aQ9D4Y3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rhox2aQ9D4Y3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rhox2aQ9D4Y3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rhox2aQ9D4Y3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rhox2aQ9D4Y3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rhox2aQ9D4Y3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rhox2aQ9D4Y3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rhox2aQ9D4Y3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rhox2aQ9D4Y3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rhox2aQ9D4Y3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rhox2aQ9D4Y3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rhox2aQ9D4Y3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rhox2aQ9D4Y3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rhox2aQ9D4Y3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rhox2aQ9D4Y3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rhox2aQ9D4Y3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rhox2aQ9D4Y3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rhox2aQ9D4Y3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rhox2aQ9D4Y3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rhox2aQ9D4Y3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rhox2aQ9D4Y3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rhox2aQ9D4Y3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rhox2aQ9D4Y3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rhox2aQ9D4Y3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rhox2aQ9D4Y3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rhox2aQ9D4Y3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rhox2aQ9D4Y3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rhox2aQ9D4Y3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rhox2aQ9D4Y3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rhox2aQ9D4Y3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rhox2aQ9D4Y3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rhox2aQ9D4Y3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rhox2aQ9D4Y3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhox2aQ9D4Y3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhox2aQ9D4Y3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhox2aQ9D4Y3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhox2aQ9D4Y3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhox2aQ9D4Y3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhox2aQ9D4Y3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhox2aQ9D4Y3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhox2aQ9D4Y3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhox2aQ9D4Y3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhox2aQ9D4Y3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhox2aQ9D4Y3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhox2aQ9D4Y3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhox2aQ9D4Y3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhox2aQ9D4Y3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhox2aQ9D4Y3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhox2aQ9D4Y3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhox2aQ9D4Y3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhox2aQ9D4Y3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rhox2aQ9D4Y3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rhox2aQ9D4Y3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rhox2aQ9D4Y3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rhox2aQ9D4Y3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rhox2aQ9D4Y3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhox2aQ9D4Y3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhox2aQ9D4Y3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhox2aQ9D4Y3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhox2aQ9D4Y3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhox2aQ9D4Y3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhox2aQ9D4Y3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhox2aQ9D4Y3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhox2aQ9D4Y3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhox2aQ9D4Y3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhox2aQ9D4Y3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhox2aQ9D4Y3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhox2aQ9D4Y3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox2aQ9D4Y3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox2aQ9D4Y3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox2aQ9D4Y3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox2aQ9D4Y3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox2aQ9D4Y3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox2aQ9D4Y3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox2aQ9D4Y3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhox2aQ9D4Y3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms