Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4W2

Uncharacterized protein C11orf65 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D4W2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D4W2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D4W2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D4W2 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D4W2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D4W2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D4W2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D4W2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D4W2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D4W2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D4W2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D4W2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D4W2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D4W2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D4W2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D4W2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D4W2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D4W2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D4W2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D4W2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D4W2 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D4W2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D4W2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D4W2 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D4W2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D4W2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D4W2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D4W2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D4W2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D4W2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D4W2 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D4W2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D4W2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9D4W2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9D4W2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9D4W2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9D4W2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9D4W2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9D4W2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9D4W2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9D4W2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9D4W2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9D4W2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9D4W2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9D4W2 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9D4W2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9D4W2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9D4W2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9D4W2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9D4W2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D4W2 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D4W2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D4W2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D4W2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D4W2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D4W2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D4W2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D4W2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D4W2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D4W2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D4W2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D4W2 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D4W2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D4W2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D4W2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D4W2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D4W2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D4W2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D4W2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D4W2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D4W2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D4W2 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D4W2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D4W2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D4W2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D4W2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D4W2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D4W2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D4W2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D4W2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D4W2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D4W2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D4W2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q9D4W2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q9D4W2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q9D4W2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9D4W2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9D4W2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9D4W2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9D4W2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9D4W2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9D4W2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9D4W2 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9D4W2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9D4W2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9D4W2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9D4W2 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9D4W2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9D4W2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9D4W2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms