Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc83Q9D4V3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc83Q9D4V3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc83Q9D4V3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc83Q9D4V3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc83Q9D4V3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc83Q9D4V3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc83Q9D4V3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc83Q9D4V3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc83Q9D4V3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc83Q9D4V3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc83Q9D4V3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc83Q9D4V3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc83Q9D4V3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc83Q9D4V3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc83Q9D4V3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc83Q9D4V3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc83Q9D4V3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc83Q9D4V3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc83Q9D4V3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc83Q9D4V3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc83Q9D4V3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc83Q9D4V3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc83Q9D4V3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc83Q9D4V3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc83Q9D4V3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc83Q9D4V3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc83Q9D4V3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc83Q9D4V3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc83Q9D4V3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc83Q9D4V3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ccdc83Q9D4V3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ccdc83Q9D4V3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ccdc83Q9D4V3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc83Q9D4V3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc83Q9D4V3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc83Q9D4V3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc83Q9D4V3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc83Q9D4V3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc83Q9D4V3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc83Q9D4V3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc83Q9D4V3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc83Q9D4V3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc83Q9D4V3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc83Q9D4V3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc83Q9D4V3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc83Q9D4V3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc83Q9D4V3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc83Q9D4V3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc83Q9D4V3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc83Q9D4V3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc83Q9D4V3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc83Q9D4V3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc83Q9D4V3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc83Q9D4V3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc83Q9D4V3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc83Q9D4V3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc83Q9D4V3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc83Q9D4V3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc83Q9D4V3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc83Q9D4V3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc83Q9D4V3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc83Q9D4V3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc83Q9D4V3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc83Q9D4V3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc83Q9D4V3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc83Q9D4V3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc83Q9D4V3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc83Q9D4V3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc83Q9D4V3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc83Q9D4V3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc83Q9D4V3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc83Q9D4V3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc83Q9D4V3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc83Q9D4V3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc83Q9D4V3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc83Q9D4V3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc83Q9D4V3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc83Q9D4V3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc83Q9D4V3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc83Q9D4V3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc83Q9D4V3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc83Q9D4V3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc83Q9D4V3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc83Q9D4V3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc83Q9D4V3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc83Q9D4V3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc83Q9D4V3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc83Q9D4V3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc83Q9D4V3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc83Q9D4V3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc83Q9D4V3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc83Q9D4V3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc83Q9D4V3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc83Q9D4V3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc83Q9D4V3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc83Q9D4V3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc83Q9D4V3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc83Q9D4V3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc83Q9D4V3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms