Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C9

Clvs1, Clavesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clvs1Q9D4C9 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clvs1Q9D4C9 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clvs1Q9D4C9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clvs1Q9D4C9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clvs1Q9D4C9 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clvs1Q9D4C9 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clvs1Q9D4C9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clvs1Q9D4C9 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clvs1Q9D4C9 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Clvs1Q9D4C9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Clvs1Q9D4C9 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clvs1Q9D4C9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clvs1Q9D4C9 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clvs1Q9D4C9 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clvs1Q9D4C9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clvs1Q9D4C9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clvs1Q9D4C9 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clvs1Q9D4C9 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clvs1Q9D4C9 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clvs1Q9D4C9 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clvs1Q9D4C9 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clvs1Q9D4C9 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clvs1Q9D4C9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clvs1Q9D4C9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clvs1Q9D4C9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clvs1Q9D4C9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clvs1Q9D4C9 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clvs1Q9D4C9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clvs1Q9D4C9 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clvs1Q9D4C9 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clvs1Q9D4C9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clvs1Q9D4C9 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Clvs1Q9D4C9 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Clvs1Q9D4C9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Clvs1Q9D4C9 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clvs1Q9D4C9 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clvs1Q9D4C9 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clvs1Q9D4C9 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clvs1Q9D4C9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clvs1Q9D4C9 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clvs1Q9D4C9 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clvs1Q9D4C9 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clvs1Q9D4C9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clvs1Q9D4C9 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clvs1Q9D4C9 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clvs1Q9D4C9 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clvs1Q9D4C9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clvs1Q9D4C9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clvs1Q9D4C9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Clvs1Q9D4C9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clvs1Q9D4C9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clvs1Q9D4C9 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clvs1Q9D4C9 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Clvs1Q9D4C9 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clvs1Q9D4C9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clvs1Q9D4C9 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clvs1Q9D4C9 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clvs1Q9D4C9 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clvs1Q9D4C9 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clvs1Q9D4C9 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clvs1Q9D4C9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clvs1Q9D4C9 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clvs1Q9D4C9 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clvs1Q9D4C9 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clvs1Q9D4C9 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clvs1Q9D4C9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clvs1Q9D4C9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clvs1Q9D4C9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clvs1Q9D4C9 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clvs1Q9D4C9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clvs1Q9D4C9 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clvs1Q9D4C9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clvs1Q9D4C9 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clvs1Q9D4C9 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clvs1Q9D4C9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Clvs1Q9D4C9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Clvs1Q9D4C9 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clvs1Q9D4C9 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clvs1Q9D4C9 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Clvs1Q9D4C9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clvs1Q9D4C9 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clvs1Q9D4C9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clvs1Q9D4C9 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clvs1Q9D4C9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clvs1Q9D4C9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clvs1Q9D4C9 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clvs1Q9D4C9 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clvs1Q9D4C9 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clvs1Q9D4C9 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clvs1Q9D4C9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clvs1Q9D4C9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Clvs1Q9D4C9 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clvs1Q9D4C9 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Clvs1Q9D4C9 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clvs1Q9D4C9 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clvs1Q9D4C9 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clvs1Q9D4C9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clvs1Q9D4C9 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clvs1Q9D4C9 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clvs1Q9D4C9 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms