Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Syce1Q9D495 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Syce1Q9D495 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Syce1Q9D495 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Syce1Q9D495 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Syce1Q9D495 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Syce1Q9D495 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Syce1Q9D495 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Syce1Q9D495 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Syce1Q9D495 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Syce1Q9D495 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Syce1Q9D495 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Syce1Q9D495 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Syce1Q9D495 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Syce1Q9D495 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Syce1Q9D495 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Syce1Q9D495 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Syce1Q9D495 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Syce1Q9D495 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Syce1Q9D495 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Syce1Q9D495 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Syce1Q9D495 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Syce1Q9D495 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Syce1Q9D495 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Syce1Q9D495 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Syce1Q9D495 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Syce1Q9D495 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Syce1Q9D495 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Syce1Q9D495 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Syce1Q9D495 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Syce1Q9D495 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Syce1Q9D495 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Syce1Q9D495 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Syce1Q9D495 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Syce1Q9D495 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Syce1Q9D495 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Syce1Q9D495 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Syce1Q9D495 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Syce1Q9D495 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Syce1Q9D495 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Syce1Q9D495 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Syce1Q9D495 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Syce1Q9D495 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Syce1Q9D495 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Syce1Q9D495 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Syce1Q9D495 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Syce1Q9D495 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Syce1Q9D495 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Syce1Q9D495 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Syce1Q9D495 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Syce1Q9D495 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Syce1Q9D495 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Syce1Q9D495 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Syce1Q9D495 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Syce1Q9D495 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Syce1Q9D495 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Syce1Q9D495 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Syce1Q9D495 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Syce1Q9D495 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Syce1Q9D495 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Syce1Q9D495 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Syce1Q9D495 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Syce1Q9D495 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Syce1Q9D495 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Syce1Q9D495 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Syce1Q9D495 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Syce1Q9D495 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Syce1Q9D495 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Syce1Q9D495 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Syce1Q9D495 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Syce1Q9D495 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Syce1Q9D495 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Syce1Q9D495 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Syce1Q9D495 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Syce1Q9D495 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Syce1Q9D495 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Syce1Q9D495 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Syce1Q9D495 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Syce1Q9D495 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Syce1Q9D495 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Syce1Q9D495 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Syce1Q9D495 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Syce1Q9D495 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Syce1Q9D495 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Syce1Q9D495 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Syce1Q9D495 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Syce1Q9D495 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Syce1Q9D495 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Syce1Q9D495 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Syce1Q9D495 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Syce1Q9D495 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Syce1Q9D495 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Syce1Q9D495 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Syce1Q9D495 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Syce1Q9D495 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Syce1Q9D495 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Syce1Q9D495 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Syce1Q9D495 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Syce1Q9D495 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Syce1Q9D495 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms